| 查看: 558 | 回复: 0 | ||
[求助]
核糖体DNA扩增片段限制性内切酶分析方面的问题
|
|
本人在做 ARDRA（核糖体DNA扩增片段限制性内切酶分析），然后算相似性系数，划分OTU，聚类，测序。目前酶切已做完，进一步的分析有些问题弄不清楚，向大家求教。 1.酶切完之后要算各个之间样品的相似系数，样品很多，有12个样品，每个样品挑了了100个斑来切，是不是要先做成0－1矩阵，再用软件来算？0－1矩阵具体怎么弄，然后用什么软件来计算呢 2。准备把相似性大于97％的分为一个OTU，有1000多个酶切的，算完相似性系数后，可不可以用软件来自动划分OTU，具体怎么弄呢 3. 聚类分析准备用MVSP，采用非加权配对算数平均法， similarity or distance该选哪一种呢 |
回复此楼» 猜你喜欢
碳青霉烯类抗生素为何需联用西司他丁钠？ | Biochempartner
已经有0人回复
-
源自蕨类植物的抗炎美白活性分子去甲氧基荚果蕨素 | Biochempartner
已经有0人回复
-
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有92人回复
-
肠道里的"代谢开关"：Fexaramine用肠道限制性重新定义 FXR 激动剂
已经有0人回复
-
DMXAA：从血管破坏剂到STING通路研究的关键工具分子 | Biochempartner
已经有0人回复
-
靶向PD-L1的人源化单克隆抗体阿特珠单抗
已经有0人回复
-
"探针之父"(+)-JQ-1如何改变表观遗传研究 | Biochempartner
已经有0人回复
-
含氟糖皮质激素的外用抗炎利器醋酸氟轻松
已经有0人回复
-
阿莫奈韦（Amenamevir）：解旋酶-引物酶靶向分子的结构特征与合成路径全解析
已经有0人回复
-
利瑞鲁单抗：靶向KIR的NK细胞检查点工具抗体，结构基础与科研应用全解析
已经有0人回复
-
Wnt-C59：PORCN靶向化学探针，Wnt信号通路阻断机制与科研应用全解析
已经有0人回复
找到一些相关的精华帖子，希望有用哦~
细菌属种鉴定问题
已经有21人回复
- 如何设计引物扩增片段？做克隆的
已经有11人回复
- 序列分析数据库及相关网址
已经有5人回复
点击这里搜索更多相关资源科研从小木虫开始，人人为我，我为人人