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求问，蛋白质和小分子结合，应该从哪些角度解释它们的结合强度不一样 已有2人参与
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我是分析化学专业的，对于蛋白质不太了解。。 求问。。。蛋白A和B，是同一种蛋白的不同基因变体。只有两个氨基酸是不一样的，其他氨基酸完全相同。 它们分别和小分子C结合，通过算结合常数，B比A结合的强一些。但是，怎么解释呢？这个小分子结合在蛋白质外表面（没有进入内部疏水空腔） 能不能说因为这两个位点的氨基酸的大小，B比A小，所以可以结合？我导师说不能，说这个没有多大影响。 能不能autodock后，说因为B和C形成的氢键长度，比A和C形成的氢键长度小，所以B的氢键强一些，所以结合的好一些 这小分子C是一种酸，有COOH，还有很多F。。那么能不能从这些官能团和氨基酸结合的基团来说？ 求解释。。。。 |
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