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微卫星数据处理
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最近处理微卫星数据，一共七个种，每个种选择3-7个样本，用9条引物跑了毛细管，用Cervus软件处理，Ho都基本是1，He基本在0.7-1之间，请问这正常吗？ 其中一个结果： Number of individuals typed: 10 Heterozygotes: 10 Homozygotes: 0 Number of alleles: 14 Observed heterozygosity: 1.0000 Expected heterozygosity: 0.9632 Polymorphic information content (PIC): 0.9087 Average non-exclusion probability (firstparent): 0.2944 Average non-exclusion probability (secondparent): 0.1722 Average non-exclusion probability (parentpair): 0.0485 Average non-exclusion probability(identity): 0.0135 Average non-exclusion probability (sibidentity): 0.2959 Hardy-Weinberg equilibrium test: Not done Null allele frequency estimate: -0.0452 计算等位基因数、Ho、He最好用哪个软件啊？ 谢谢各位大侠！！！！ |
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2楼2016-09-18 11:15:12