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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 计算模拟 » [求助]如何给小分子数据库加原子电荷
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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aladin8201

[交流] [求助]如何给小分子数据库加原子电荷

如题，请问我有一个mol2格式的小分子数据库，我如何能批量的给这个小分子数据库文件中的每一个小分子添加原子电荷，有什么软件可以完成吗？

谢谢！！！！
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1楼 2008-06-19 17:51:39
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ky96998

金虫 (小有名气)
★
lei0736(金币+1,VIP+0):谢谢 十大“耐思”版主评选欢迎参与投票 http://edu.emuch.net/bbs/viewthread.php?tid=845527&fpage=1
用MSS打开数据库，在compute-charges在里面选电荷类型就能添加了。不用编什么脚本
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8楼2008-06-23 00:21:31
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_steven

木虫 (正式写手)
★
lei0736(金币+1,VIP+0):谢谢
可以用Sybyl来做，写个脚本批量处理。我之前处理过给ACD，CMC，MDDR等数据库加氢、加Gasteiger-Huckel电荷、能量优化。
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2楼2008-06-19 18:08:54
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aladin8201

引用回帖:
Originally posted by _steven at 2008-6-19 18:08:
可以用Sybyl来做，写个脚本批量处理。我之前处理过给ACD，CMC，MDDR等数据库加氢、加Gasteiger-Huckel电荷、能量优化。

谢谢， 能给我发个脚本吗，是新手，对sybyl的脚本编写不懂。
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3楼2008-06-19 18:47:55
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linxi1454

银虫 (正式写手)
电荷最好用dmol算一下
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4楼2008-06-20 13:11:01
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