应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 计算模拟 » [求助]如何给小分子数据库加原子电荷
51/1返回列表
查看: 966  |  回复: 7
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前主题已经存档。
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

aladin8201

[交流] [求助]如何给小分子数据库加原子电荷

如题，请问我有一个mol2格式的小分子数据库，我如何能批量的给这个小分子数据库文件中的每一个小分子添加原子电荷，有什么软件可以完成吗？

谢谢！！！！
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
1楼 2008-06-19 17:51:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

chemhz

铁杆木虫 (正式写手)
现在的sybyl版本的spl脚本已经没有了！    不能免费使用了！ 哪位站友能分享一下！？ 谢谢！
赞一下 回复此楼
5楼2008-06-20 14:26:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 8 个回答

_steven

木虫 (正式写手)
★
lei0736(金币+1,VIP+0):谢谢
可以用Sybyl来做，写个脚本批量处理。我之前处理过给ACD，CMC，MDDR等数据库加氢、加Gasteiger-Huckel电荷、能量优化。
赞一下(10人) 回复此楼
2楼2008-06-19 18:08:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

aladin8201

引用回帖:
Originally posted by _steven at 2008-6-19 18:08:
可以用Sybyl来做，写个脚本批量处理。我之前处理过给ACD，CMC，MDDR等数据库加氢、加Gasteiger-Huckel电荷、能量优化。

谢谢， 能给我发个脚本吗，是新手，对sybyl的脚本编写不懂。
赞一下 回复此楼
3楼2008-06-19 18:47:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

linxi1454

银虫 (正式写手)
电荷最好用dmol算一下
赞一下 回复此楼
4楼2008-06-20 13:11:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 8 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭