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wanghuiliwei

银虫 (小有名气)

[求助] 急求,在线等,关于diamoand画图时出现原子重叠,怎么办呢? 已有1人参与

大家好,附件中HNUST-1的cif文件(文件来源:10.1039/C3CE26177H)
但是用diamond的画图,在画其中苯环的时候总是C原子重叠的问题,如下图所示,不知这是为什么,请高手指教急求,在线等,关于diamoand画图时出现原子重叠,怎么办呢?
picture.png
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  • 附件 1 : c3ce26177h.cif.txt
  • 2015-03-05 21:17:36, 12.86 K

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天道酬勤
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我想更懂你29

专家顾问 (文坛精英)

楼主的头像是指环王啊
以大多数人的努力程度,还轮不到去拼天赋的地步
3楼2015-03-05 21:37:48
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我想更懂你29

专家顾问 (文坛精英)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
wanghuiliwei: 金币+5 2015-03-05 21:59:28
因为那是无序结构,一个原子在两个位置上都有热震动,你画图的时候不用管,我是习惯保留占有率大的一个就行
以大多数人的努力程度,还轮不到去拼天赋的地步
2楼2015-03-05 21:36:42
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wanghuiliwei

银虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 我想更懂你29 at 2015-03-05 21:36:42
因为那是无序结构,一个原子在两个位置上都有热震动,你画图的时候不用管,我是习惯保留占有率大的一个就行

同学你好,根据文献中,Cu的配位方式应为paddlewheel状结构
但是不知为什么,我这用原子生长的方法画不出Cu的paddlewheel状结构,而且这个结构中无序的原子可能比较多,有什么方法可以直接滤掉所有无序的原子吗。cif文件在附件中,可以的话,麻烦你看看吧,辛苦你了,万分感谢
天道酬勤
4楼2015-03-05 22:41:04
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我想更懂你29

专家顾问 (文坛精英)

【答案】应助回帖

引用回帖:
4楼: Originally posted by wanghuiliwei at 2015-03-05 22:41:04
同学你好,根据文献中,Cu的配位方式应为paddlewheel状结构
但是不知为什么,我这用原子生长的方法画不出Cu的paddlewheel状结构,而且这个结构中无序的原子可能比较多,有什么方法可以直接滤掉所有无序的原子吗。 ...

明轮结构我在olex里确实看到了,不知道为什么你画不出来,至于过滤无序的原子,我所知道的方法还做不好,祝好运
以大多数人的努力程度,还轮不到去拼天赋的地步
5楼2015-03-07 16:41:48
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