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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 材料区 » 晶体 » 晶体软件 » 急求，在线等，关于diamoand画图时出现原子重叠，怎么办呢？
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wanghuiliwei

银虫 (小有名气)

[求助] 急求，在线等，关于diamoand画图时出现原子重叠，怎么办呢？ 已有1人参与

大家好，附件中HNUST-1的cif文件（文件来源：10.1039/C3CE26177H）
但是用diamond的画图，在画其中苯环的时候总是C原子重叠的问题，如下图所示，不知这是为什么，请高手指教急求，在线等，关于diamoand画图时出现原子重叠，怎么办呢？
picture.png
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  • 附件 1 : c3ce26177h.cif.txt
    • 2015-03-05 21:17:36, 12.86 K

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天道酬勤
1楼 2015-03-05 21:21:28
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我想更懂你29

专家顾问 (文坛精英)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
wanghuiliwei: 金币+5 2015-03-05 21:59:28
因为那是无序结构，一个原子在两个位置上都有热震动，你画图的时候不用管，我是习惯保留占有率大的一个就行
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以大多数人的努力程度，还轮不到去拼天赋的地步
2楼2015-03-05 21:36:42
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我想更懂你29

专家顾问 (文坛精英)
楼主的头像是指环王啊
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以大多数人的努力程度，还轮不到去拼天赋的地步
3楼2015-03-05 21:37:48
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wanghuiliwei

银虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 我想更懂你29 at 2015-03-05 21:36:42
因为那是无序结构，一个原子在两个位置上都有热震动，你画图的时候不用管，我是习惯保留占有率大的一个就行

同学你好，根据文献中，Cu的配位方式应为paddlewheel状结构
但是不知为什么，我这用原子生长的方法画不出Cu的paddlewheel状结构，而且这个结构中无序的原子可能比较多，有什么方法可以直接滤掉所有无序的原子吗。cif文件在附件中，可以的话，麻烦你看看吧，辛苦你了，万分感谢
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天道酬勤
4楼2015-03-05 22:41:04
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我想更懂你29

专家顾问 (文坛精英)

【答案】应助回帖

引用回帖:
4楼: Originally posted by wanghuiliwei at 2015-03-05 22:41:04
同学你好，根据文献中，Cu的配位方式应为paddlewheel状结构
但是不知为什么，我这用原子生长的方法画不出Cu的paddlewheel状结构，而且这个结构中无序的原子可能比较多，有什么方法可以直接滤掉所有无序的原子吗。 ...

明轮结构我在olex里确实看到了，不知道为什么你画不出来，至于过滤无序的原子，我所知道的方法还做不好，祝好运
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以大多数人的努力程度，还轮不到去拼天赋的地步
5楼2015-03-07 16:41:48
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