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libugou金虫 (正式写手)
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【求助】请问如何用ADT生成受体的flexible residue file！
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在UsingAutoDock4WithADT_1.4.5b.pdf中,使用的例子是一个蛋白质， Flexible Residues ➞ Choose Tor sions in Currently Selected Residues… 在ADT中会自动用不同的颜色标识rotatable bond, unrotatable bond和non-rotatable bond. 我的受体不是一个蛋白质，分子量较小，1000左右，所以我选择整个分子，再 Flexible Residues ➞ Choose Tor sions in Currently Selected Residues… 结果在ADT中出现一个对话框： CAUTION:currentlu processing all the residues in rececptor will be very time consuming. Do you wish to continue? 我选择Yes。接着又出现一个对话框： Select Root Atom...... 我选择了其中的一个碳原子，然后点击ok, 接着又出现一个警示框： Warning: Current selected residues have no active torsion! 敬请版主和各路高人指点迷津！！！ [ Last edited by zzgyb on 2008-6-17 at 09:16 ] |
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