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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 材料区 » 晶体 » CIF专栏 » Check CIF时出现的一些问题
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hongwinter

金虫 (小有名气)

[交流] Check CIF时出现的一些问题

check cif 时存在一些问题，如下：
PLAT113_ALERT_2_A ADDSYM Suggests Possible Pseudo/New Space-group.       C2/c

另外，如果我的晶体晶系名称为monclinic，空间群名称为Cc，请问_symmetry_space_group_name_hall 是什么？
哪位高手能,帮忙解决，不胜感激！
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1楼 2008-06-13 13:25:40
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gujm516

金虫 (小有名气)
★ ★ ★ ★
q68(金币+1,VIP+0):感谢回复
hongwinter(金币+3,VIP+0):非常感谢!
check指出这个结构存在伪对称，建议用C2/c空间群。

对于C2/c空间群：
_symmetry_space_group_name_H-M        'C 1 2/c 1'
_symmetry_space_group_name_Hall       '-C 2yc'

对于Cc空间群
_symmetry_space_group_name_H-M        'C 1 2/c 1'
_symmetry_space_group_name_Hall       ' C -2yc'
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2楼2008-06-13 13:47:39
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hongwinter

金虫 (小有名气)
谢谢gujm516的热情帮助
请问下

对于C2/c空间群：
_symmetry_space_group_name_H-M        'C 1 2/c 1'
_symmetry_space_group_name_Hall       '-C 2yc'

对于Cc空间群
_symmetry_space_group_name_H-M        'C 1 2/c 1'
_symmetry_space_group_name_Hall       ' C -2yc'

为什么C2/c和Cc空间群中_symmetry_space_group_name_H-M 都是 'C 1 2/c 1'
还有，我在cif中按照checkcif建议把空间群改为C2/c空间群，为什么checkcif仍然出现A类问题PLAT113_ALERT_2_A ADDSYM Suggests Possible Pseudo/New Space-group.       C2/c

[ Last edited by hongwinter on 2008-6-13 at 19:42 ]
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3楼2008-06-13 19:25:29
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paopaomeng

铁杆木虫 (著名写手)
这个不是说直接在cif中改了就可以的，你需要重新精修你的结构，先用plton转到新的空间群，再修
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经历了“删除门”，有点晕！
4楼2008-06-13 19:47:13
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gujm516

金虫 (小有名气)
1. 非常抱歉，在回答楼主问题时采用的是‘复制、粘贴’的办法，结果忘改空间群Cc了。前一个是 C 2/c，后面一个是 C c。

2. check提示出现伪对称，建议用 C 2/c空间群。
    这不是改动CIF那么简单的事，最好是重新解结构，用 C 2/c 空间群试试是否更合理。
    少数时候提高对称性并不一定合理，这就要从你的结构合理性出发进行解释，还要在CIF中添加：
PROBLEM: ......
RESPONSE: ......
来回答。
例如：
_vrf_PLAT_111_I
;
PROBLEM: _A ADDSYM Detects (Pseudo) Centre of Symmetry ...
                   100 Perc Fit
RESPONSE:  The acid used was enantiopure (S)-malic acid and the
ADDSYM result is an artefact of the anion disorder.  ADDSYM reaches
its conclusion having excluded all the atoms of the disordered
anion, i.e. of the very component which is chiral. See Comment text.  
;
_vrf_PLAT_113_I
;
PROBLEM: _A ADDSYM Suggests Possible Pseudo/New Spacegroup  
                    P-1         
RESPONSE: .See above
;
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5楼2008-06-13 22:19:16
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sunshinesbs

铜虫 (小有名气)
弱弱地问一下，这个HALL是用什么软件计算地？
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6楼2008-06-14 16:47:33
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Shelly809

铜虫 (正式写手)
用platon检测的时候会给出space_group_name_Hall

WaveLength 0.71073    Volume Reported     975.1(3)  Calculated     975.1(3)
# SpaceGroup from Symmetry P -1          Hall: -P 1
#                 Reported ?                    ?
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时间检验一切
7楼2008-06-18 19:23:10
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Shelly809

铜虫 (正式写手)
PLAT113_ALERT_2_A ADDSYM Suggests Possible Pseudo/New Space-group.       C2/c
需要考虑空间群是不是给错的问题
如果是对称性低的话，可以用platon增加对称性，改为对称性较高的空间群
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时间检验一切
8楼2008-06-18 19:28:08
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