24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 923  |  回复: 7
当前主题已经存档。

hongwinter

金虫 (小有名气)

[交流] Check CIF时出现的一些问题

check cif 时存在一些问题,如下:
PLAT113_ALERT_2_A ADDSYM Suggests Possible Pseudo/New Space-group.       C2/c

另外,如果我的晶体晶系名称为monclinic,空间群名称为Cc,请问_symmetry_space_group_name_hall 是什么?
哪位高手能,帮忙解决,不胜感激!
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gujm516

金虫 (小有名气)

★ ★ ★ ★
q68(金币+1,VIP+0):感谢回复
hongwinter(金币+3,VIP+0):非常感谢!
check指出这个结构存在伪对称,建议用C2/c空间群。

对于C2/c空间群:
_symmetry_space_group_name_H-M        'C 1 2/c 1'
_symmetry_space_group_name_Hall       '-C 2yc'

对于Cc空间群
_symmetry_space_group_name_H-M        'C 1 2/c 1'
_symmetry_space_group_name_Hall       ' C -2yc'
2楼2008-06-13 13:47:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hongwinter

金虫 (小有名气)

谢谢gujm516的热情帮助
请问下

对于C2/c空间群:
_symmetry_space_group_name_H-M        'C 1 2/c 1'
_symmetry_space_group_name_Hall       '-C 2yc'

对于Cc空间群
_symmetry_space_group_name_H-M        'C 1 2/c 1'
_symmetry_space_group_name_Hall       ' C -2yc'

为什么C2/c和Cc空间群中_symmetry_space_group_name_H-M 都是 'C 1 2/c 1'
还有,我在cif中按照checkcif建议把空间群改为C2/c空间群,为什么checkcif仍然出现A类问题PLAT113_ALERT_2_A ADDSYM Suggests Possible Pseudo/New Space-group.       C2/c

[ Last edited by hongwinter on 2008-6-13 at 19:42 ]
3楼2008-06-13 19:25:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

paopaomeng

铁杆木虫 (著名写手)

这个不是说直接在cif中改了就可以的,你需要重新精修你的结构,先用plton转到新的空间群,再修
经历了“删除门”,有点晕!
4楼2008-06-13 19:47:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gujm516

金虫 (小有名气)

1. 非常抱歉,在回答楼主问题时采用的是‘复制、粘贴’的办法,结果忘改空间群Cc了。前一个是 C 2/c,后面一个是 C c。

2. check提示出现伪对称,建议用 C 2/c空间群。
    这不是改动CIF那么简单的事,最好是重新解结构,用 C 2/c 空间群试试是否更合理。
    少数时候提高对称性并不一定合理,这就要从你的结构合理性出发进行解释,还要在CIF中添加:
PROBLEM: ......
RESPONSE: ......
来回答。
例如:
_vrf_PLAT_111_I
;
PROBLEM: _A ADDSYM Detects (Pseudo) Centre of Symmetry ...
                   100 Perc Fit
RESPONSE:  The acid used was enantiopure (S)-malic acid and the
ADDSYM result is an artefact of the anion disorder.  ADDSYM reaches
its conclusion having excluded all the atoms of the disordered
anion, i.e. of the very component which is chiral. See Comment text.  
;
_vrf_PLAT_113_I
;
PROBLEM: _A ADDSYM Suggests Possible Pseudo/New Spacegroup  
                    P-1         
RESPONSE: .See above
;
5楼2008-06-13 22:19:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sunshinesbs

铜虫 (小有名气)

弱弱地问一下,这个HALL是用什么软件计算地?
6楼2008-06-14 16:47:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Shelly809

铜虫 (正式写手)

用platon检测的时候会给出space_group_name_Hall

WaveLength 0.71073    Volume Reported     975.1(3)  Calculated     975.1(3)
# SpaceGroup from Symmetry P -1          Hall: -P 1
#                 Reported ?                    ?
时间检验一切
7楼2008-06-18 19:23:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Shelly809

铜虫 (正式写手)

PLAT113_ALERT_2_A ADDSYM Suggests Possible Pseudo/New Space-group.       C2/c
需要考虑空间群是不是给错的问题
如果是对称性低的话,可以用platon增加对称性,改为对称性较高的空间群
时间检验一切
8楼2008-06-18 19:28:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 hongwinter 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 071000生物学,一志愿深圳大学296分,求调剂 +3 TIckLw 2026-04-06 3/150 2026-04-06 23:12 by 52305043001
[考研] 初试301,代码085701环境工程,本硕一致,四六级已过,有二区一作,共发表5篇论文 +10 axibli 2026-04-01 11/550 2026-04-06 22:39 by guanxin1001
[考研] 297分083200求助 +9 aekx 2026-04-05 9/450 2026-04-06 20:57 by flysky1234
[考研] 一志愿北京2,材料与化工308求调剂 +13 熊二想上岸 2026-04-04 14/700 2026-04-06 19:42 by guanxin1001
[考研] 336材料与化工085600求调剂 +9 水星记infp 2026-04-05 12/600 2026-04-06 11:46 by 水星记infp
[考研] 一志愿南昌大学,085600,344分求调剂 +9 调剂上岸玘 2026-04-05 10/500 2026-04-06 09:30 by dongzh2009
[考研] 材料调剂 +6 一样YWY 2026-04-05 6/300 2026-04-05 20:30 by 南航~万老师
[考研] 272求调剂 +4 电气李 2026-04-05 4/200 2026-04-05 10:41 by lbsjt
[考研] 一志愿华北电力大学(北京),材料科学与工程学硕265,求调剂 +11 yelck 2026-04-03 12/600 2026-04-04 19:52 by dongzh2009
[考研] 一志愿沪9,求生物学调剂,326分 +6 刘墨墨 2026-04-04 6/300 2026-04-04 19:44 by 唐沐儿
[考研] 368求调剂 +5 今华习 2026-04-03 7/350 2026-04-04 18:47 by imissbao
[考研] 调剂 +5 asdasdassda 2026-04-03 6/300 2026-04-03 20:27 by 岸上的一条鱼
[硕博家园] 求老师收留 +9 lllq123 2026-04-03 9/450 2026-04-03 13:48 by 呼吸都是减肥
[考研] 材料调剂 +4 一样YWY 2026-04-03 4/200 2026-04-03 09:48 by 蓝云思雨
[考研] 一志愿武汉理工0856,初试334 +3 26考研材料 2026-04-02 3/150 2026-04-02 21:22 by dongzh2009
[考研] 材料工程322分 +8 哈哈哈吼吼吼哈 2026-04-01 8/400 2026-04-02 11:53 by 3041
[考研] 0805求调剂 +8 是水分 2026-03-31 8/400 2026-04-02 10:46 by guanxin1001
[考研] 372求调剂 +3 jj涌77 2026-04-02 3/150 2026-04-02 09:57 by olim
[考研] 279求调剂 +6 学而思兮知 2026-04-01 6/300 2026-04-02 09:16 by vgtyfty
[考研] 考研材料工程351分调剂 +5 整个好的 2026-03-31 5/250 2026-04-01 09:36 by topgun2009
信息提示
请填处理意见