24小时热门版块排行榜    

查看: 544  |  回复: 1

渭水飞熊

木虫 (小有名气)

[求助] antechamber 限制电荷问题 已有1人参与

在分子模拟中,需要建一个力场,在优化电荷的时候,使用ambertools里的antechamber进行resp电荷的拟合,这些都没问题;
问题是:参考文献中,在这个长的碳链中,除了首尾的位置外,其他的中间的-CH2-需要限制电荷相等,这样方便建力场,但在antechamber不怎么会使用,看说明书也晕晕乎乎的,不知道如何限制。
希望各位大牛能不吝指导,怎样使用antechamber或ambertools中的工具使得中间的相同的-CH2-的电荷限制成一样的!!
先谢谢啦!

antechamber 限制电荷问题
1.png
回复此楼
盐是淡的,水是咸的
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tracel

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ...
渭水飞熊: 金币+100, ★★★★★最佳答案 2015-02-05 21:02:59
将RESP电荷的INPUT2 中的电荷设置限制参数参考下例(乙烷):
0  6
6  0
1  0
1  2    2表示与第2行的氢原子电荷相同(下同)
1  2
6  1    1表示与第1行的碳原子电荷相同(下同)
1  2
1  2
1  2
2楼2015-02-05 20:21:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 渭水飞熊 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +4 Z7qfCsdIiD1T 2026-11-10 6/300 2026-11-12 02:25 by 9fOTqj074tIg
[公派出国] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 czAiolzR0IJC 2026-11-10 6/300 2026-11-12 02:23 by 9fOTqj074tIg
[考研] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 Z7qfCsdIiD1T 2026-11-10 4/200 2026-11-12 02:23 by 9fOTqj074tIg
[教师之家] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 Z7qfCsdIiD1T 2026-11-10 4/200 2026-11-12 02:23 by 9fOTqj074tIg
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +4 czAiolzR0IJC 2026-11-10 4/200 2026-11-12 02:12 by 9fOTqj074tIg
[教师之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 G2rhSvqvhNzl 2026-11-10 4/200 2026-11-12 01:41 by 9fOTqj074tIg
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 C6CRn66RYYXS 2026-11-10 4/200 2026-11-12 01:39 by 9fOTqj074tIg
[公派出国] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 C6CRn66RYYXS 2026-11-10 6/300 2026-11-12 01:36 by 9fOTqj074tIg
[教师之家] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 C6CRn66RYYXS 2026-11-10 6/300 2026-11-12 01:28 by 9fOTqj074tIg
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +4 C6CRn66RYYXS 2026-11-10 6/300 2026-11-12 01:19 by 9fOTqj074tIg
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 FChKX8meu1ds 2026-11-09 7/350 2026-11-12 01:06 by 9fOTqj074tIg
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +4 FChKX8meu1ds 2026-11-09 7/350 2026-11-12 00:55 by 9fOTqj074tIg
[公派出国] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 FChKX8meu1ds 2026-11-09 8/400 2026-11-12 00:55 by 9fOTqj074tIg
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +4 Z7qfCsdIiD1T 2026-11-10 4/200 2026-11-11 22:42 by 9fOTqj074tIg
[基金申请] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +3 C6CRn66RYYXS 2026-11-10 4/200 2026-11-11 17:53 by TgvkbZZl9tqB
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +5 FChKX8meu1ds 2026-11-09 6/300 2026-11-11 17:03 by TgvkbZZl9tqB
[考研] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +5 zSbvVX9JFl9J 2026-11-09 6/300 2026-11-11 16:47 by TgvkbZZl9tqB
[硕博家园] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 zSbvVX9JFl9J 2026-11-09 7/350 2026-11-11 16:41 by TgvkbZZl9tqB
[公派出国] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +4 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 8/400 2026-11-09 00:14 by l48hFd8Nwae2
[教师之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +5 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 9/450 2026-11-08 22:46 by l48hFd8Nwae2
信息提示
请填处理意见