应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » 想知道作为结果的.xvg 中的各行的意思，谢谢
121/2返回列表12下一页
查看: 3159  |  回复: 11
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

1142634328

铜虫 (初入文坛)

[求助] 想知道作为结果的.xvg 中的各行的意思，谢谢 已有1人参与

gromacs中通过g_sas命令计算溶剂可及表面积（SAS），输出文件为area.xvg
area.xvg文件的内容：
@    title "Solvent Accessible Surface"
@    xaxis  label "Time (ps)"
@    yaxis  label "Area (nm\S2\N)"
@TYPE xy
@ view 0.15, 0.15, 0.75, 0.85
@ legend on
@ legend box on
@ legend loctype view
@ legend 0.78, 0.8
@ legend length 2
@ s0 legend "Hydrophobic"
@ s1 legend "Hydrophilic"
@ s2 legend "Total"
@ s3 legend "D Gsolv"
         1     16.0803     13.1168     29.1971     83.1227
我想知道上面各行是什么意思，有什么意义？谢谢啊
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2015-01-27 20:54:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

awaken2013

铜虫 (小有名气)
。。。你要装了grace才能打开xvg。。
命令：xmgrace -nxy xxx.xvg
赞一下 回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

1142634328
2楼2015-01-27 22:33:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wbf3ng

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
各行的意思，你用grace一看再对照那内容，就知道了，就是图，横纵坐标，线条宽度

[ 发自小木虫客户端 ]
赞一下 回复此楼
3楼2015-01-27 23:08:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

1142634328

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by awaken2013 at 2015-01-27 22:33:33
。。。你要装了grace才能打开xvg。。
命令：xmgrace -nxy xxx.xvg

在Ubuntu中我直接双击打开的
赞一下 回复此楼
4楼2015-01-27 23:12:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

awaken2013

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by wbf3ng at 2015-01-27 23:08:43
各行的意思，你用grace一看再对照那内容，就知道了，就是图，横纵坐标，线条宽度

这样看怎么看得懂。。这只是原文的一小部分吧?我用xmgrace都画不出来。
赞一下 回复此楼
5楼2015-01-27 23:14:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

1142634328

铜虫 (初入文坛)
送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by awaken2013 at 2015-01-27 22:33:33
。。。你要装了grace才能打开xvg。。
命令：xmgrace -nxy xxx.xvg

好的，我试试，谢谢啊
赞一下 回复此楼
6楼2015-01-27 23:17:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

1142634328

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by wbf3ng at 2015-01-27 23:08:43
各行的意思，你用grace一看再对照那内容，就知道了，就是图，横纵坐标，线条宽度

关键的关键是我Ubuntu上没有grace，我不会安装grace，如果你会安装，麻烦告诉我下，谢谢
赞一下 回复此楼
7楼2015-01-27 23:19:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wbf3ng

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
1142634328: 金币+10, ★★★很有帮助, 谢谢 2015-01-30 21:08:21
引用回帖:
7楼: Originally posted by 1142634328 at 2015-01-27 23:19:51
关键的关键是我Ubuntu上没有grace，我不会安装grace，如果你会安装，麻烦告诉我下，谢谢...

sudo apt-get install grace,或者在软件中心那里查找安装

[ 发自小木虫客户端 ]
赞一下 回复此楼
8楼2015-01-27 23:26:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

赵红霞

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
8楼: Originally posted by wbf3ng at 2015-01-27 23:26:42
sudo apt-get install grace,或者在软件中心那里查找安装
...

请问如何查看gromacs里溶剂可及表面（SAS）的计算源代码？
赞一下 回复此楼
9楼2015-09-15 14:08:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wbf3ng

金虫 (小有名气)
引用回帖:
9楼: Originally posted by 赵红霞 at 2015-09-15 14:08:46
请问如何查看gromacs里溶剂可及表面（SAS）的计算源代码？...

gromacs不懂，但是pymol,adt,vmd都有此功能算sas

[ 发自小木虫客户端 ]
赞一下 回复此楼
10楼2015-09-15 17:56:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 1142634328 的主题更新
121/2返回列表12下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 投票:  有多少人是今天查系统知道结果的？ +12 爱看书的可乐 2026-08-26 14/700 2026-08-26 12:25 by coolysnow
[基金申请] 系统查不到 +8 董八千 2026-08-26 8/400 2026-08-26 12:18 by soulicct
[基金申请] 国合里面能看到了 +7 一怀馨秋 2026-08-26 7/350 2026-08-26 11:23 by zhaosm1982
[基金申请] 国际合作可查了，中了面上 +18 Ldrop2023 2026-08-26 18/900 2026-08-26 11:15 by cmrandy
[基金申请] 能否退出参与的面上项目解除限项 +22 koalala 2026-08-24 25/1250 2026-08-26 11:14 by dxcharlary
[基金申请] 系统进不去 +4 yanglien 2026-08-26 5/250 2026-08-26 11:10 by wenfengw83
[基金申请] 2026年的国家社科基金项目通讯评审的新规则与新动向、新挑战 +6 process2012 2026-08-23 8/400 2026-08-26 11:03 by zjlp
[基金申请] 牛来！米来！面来！ +8 beefly 2026-08-26 8/400 2026-08-26 08:37 by xuzhipiao
[基金申请] 2026年8月25日国自然放榜前突然收到列入评审专家邮件，有关系吗？ +24 木水思豆 2026-08-25 27/1350 2026-08-26 08:26 by yanchen918
[基金申请] 范进中举一文的中心思想 +8 炎黄贵胄 2026-08-22 9/450 2026-08-26 07:47 by WASM
[基金申请] 在坚冰还盖着北海的时候，我看到了怒放的梅花。 (金币+10) +6 ziyangfang 2026-08-25 9/450 2026-08-25 20:26 by huagongfeihu
[基金申请] 明天应该可查了！？ +6 chengyan1220 2026-08-23 6/300 2026-08-25 19:45 by zfd97
[基金申请] 有没有大神帮我看看基金代码 28+4 1234567wang 2026-08-24 10/500 2026-08-25 19:15 by lfy8008
[基金申请] 放榜前的不淡定 20+4 snowwithsea 2026-08-19 19/950 2026-08-25 17:57 by chick875
[基金申请] 某些机构，以效率低为荣，以效率低作为存在感 +9 yuleib84 2026-08-25 10/500 2026-08-25 17:14 by alexon
[基金申请] 如果此刻你正在为国基感到焦虑，不妨来听听这首《基金之外》 +8 scalable 2026-08-24 8/400 2026-08-25 12:52 by jnhyjjm
[基金申请] 人气不行了 +11 fansofjerry 2026-08-21 11/550 2026-08-25 11:04 by 孤独的英雄6
[基金申请] 只有每年这种时候来逛逛小木虫 +25 yaoyewhu2008 2026-08-20 27/1350 2026-08-25 08:01 by Equinoxhua
[基金申请] 看来今天不会放榜了？ +8 chengyan1220 2026-08-21 11/550 2026-08-21 17:52 by dcqxinyang
[基金申请] 今天放榜没戏了吧 +9 yuleib84 2026-08-19 11/550 2026-08-21 10:06 by gltch
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭