应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » 想知道作为结果的.xvg 中的各行的意思，谢谢
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
121/2返回列表12下一页
查看: 3010  |  回复: 11
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

1142634328

铜虫 (初入文坛)

[求助] 想知道作为结果的.xvg 中的各行的意思，谢谢 已有1人参与

gromacs中通过g_sas命令计算溶剂可及表面积（SAS），输出文件为area.xvg
area.xvg文件的内容：
@    title "Solvent Accessible Surface"
@    xaxis  label "Time (ps)"
@    yaxis  label "Area (nm\S2\N)"
@TYPE xy
@ view 0.15, 0.15, 0.75, 0.85
@ legend on
@ legend box on
@ legend loctype view
@ legend 0.78, 0.8
@ legend length 2
@ s0 legend "Hydrophobic"
@ s1 legend "Hydrophilic"
@ s2 legend "Total"
@ s3 legend "D Gsolv"
         1     16.0803     13.1168     29.1971     83.1227
我想知道上面各行是什么意思，有什么意义？谢谢啊
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2015-01-27 20:54:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

awaken2013

铜虫 (小有名气)
。。。你要装了grace才能打开xvg。。
命令：xmgrace -nxy xxx.xvg
赞一下 回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

1142634328
2楼2015-01-27 22:33:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wbf3ng

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
各行的意思，你用grace一看再对照那内容，就知道了，就是图，横纵坐标，线条宽度

[ 发自小木虫客户端 ]
赞一下 回复此楼
3楼2015-01-27 23:08:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

1142634328

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by awaken2013 at 2015-01-27 22:33:33
。。。你要装了grace才能打开xvg。。
命令：xmgrace -nxy xxx.xvg

在Ubuntu中我直接双击打开的
赞一下 回复此楼
4楼2015-01-27 23:12:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

awaken2013

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by wbf3ng at 2015-01-27 23:08:43
各行的意思，你用grace一看再对照那内容，就知道了，就是图，横纵坐标，线条宽度

这样看怎么看得懂。。这只是原文的一小部分吧?我用xmgrace都画不出来。
赞一下 回复此楼
5楼2015-01-27 23:14:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

1142634328

铜虫 (初入文坛)
送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by awaken2013 at 2015-01-27 22:33:33
。。。你要装了grace才能打开xvg。。
命令：xmgrace -nxy xxx.xvg

好的，我试试，谢谢啊
赞一下 回复此楼
6楼2015-01-27 23:17:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

1142634328

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by wbf3ng at 2015-01-27 23:08:43
各行的意思，你用grace一看再对照那内容，就知道了，就是图，横纵坐标，线条宽度

关键的关键是我Ubuntu上没有grace，我不会安装grace，如果你会安装，麻烦告诉我下，谢谢
赞一下 回复此楼
7楼2015-01-27 23:19:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wbf3ng

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
1142634328: 金币+10, ★★★很有帮助, 谢谢 2015-01-30 21:08:21
引用回帖:
7楼: Originally posted by 1142634328 at 2015-01-27 23:19:51
关键的关键是我Ubuntu上没有grace，我不会安装grace，如果你会安装，麻烦告诉我下，谢谢...

sudo apt-get install grace,或者在软件中心那里查找安装

[ 发自小木虫客户端 ]
赞一下 回复此楼
8楼2015-01-27 23:26:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

赵红霞

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
8楼: Originally posted by wbf3ng at 2015-01-27 23:26:42
sudo apt-get install grace,或者在软件中心那里查找安装
...

请问如何查看gromacs里溶剂可及表面（SAS）的计算源代码？
赞一下 回复此楼
9楼2015-09-15 14:08:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wbf3ng

金虫 (小有名气)
引用回帖:
9楼: Originally posted by 赵红霞 at 2015-09-15 14:08:46
请问如何查看gromacs里溶剂可及表面（SAS）的计算源代码？...

gromacs不懂，但是pymol,adt,vmd都有此功能算sas

[ 发自小木虫客户端 ]
赞一下 回复此楼
10楼2015-09-15 17:56:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 1142634328 的主题更新
121/2返回列表12下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[论文投稿] chinese chemical letters英文版投稿求助 120+4 Yishengeryi 2026-03-30 6/300 2026-04-02 17:19 by Yishengeryi
[考研] 318求调剂 +3 笃行致远. 2026-03-31 4/200 2026-04-02 15:56 by Jaylen.
[考研] 302求调剂一志愿华中师范大学 +5 小江小江江江 2026-04-02 5/250 2026-04-02 15:47 by zikuzi1853
[考研] 一志愿复旦材料，英一专硕，总分357调剂 +3 1050389037 2026-04-02 4/200 2026-04-02 14:32 by olim
[考研] 265求调剂 +6 梁梁校校 2026-04-01 6/300 2026-04-02 14:29 by 客尔美德
[考研] 求调剂！生物与医药专硕 +4 逆转陆先生 2026-04-01 4/200 2026-04-02 11:51 by xiaoranmu
[考研] 求调剂，一志愿 南京航空航天大学 ，080500材料科学与工程学硕，总分289分 +11 @taotao 2026-03-29 11/550 2026-04-02 10:04 by realme321
[考研] 0710生物学，325求调剂 +3 mkkkkkl 2026-04-01 3/150 2026-04-02 09:48 by Jaylen.
[考研] 279求调剂 +6 学而思兮知 2026-04-01 6/300 2026-04-02 09:16 by vgtyfty
[考研] 266求调剂 +10 阳阳哇塞 2026-04-01 10/500 2026-04-02 09:07 by vgtyfty
[考研] 生物学327，求调剂 +5 书上的梅子 2026-04-01 6/300 2026-04-02 06:47 by ilovexiaobin
[考研] 275求调剂 +12 waltzh 2026-04-01 12/600 2026-04-01 21:44 by chyhaha
[考研] 材料专硕调剂 +17 椰椰。 2026-03-29 17/850 2026-04-01 20:44 by cq2548
[考研] 332求调剂 +8 Lyy930824@ 2026-03-29 8/400 2026-04-01 18:40 by 千钧澄玉宇啊
[考研] 江苏苏北高校诚邀调剂同学 +3 zzll406 2026-03-31 3/150 2026-03-31 16:54 by 及时行乐fan
[考研] 315求调剂 +6 akie... 2026-03-28 7/350 2026-03-31 16:48 by asdfzly
[有机交流] 考研调剂 +8 watb 2026-03-26 8/400 2026-03-30 18:40 by 544594351
[考研] 303求调剂 +7 DLkz1314. 2026-03-30 7/350 2026-03-30 16:05 by shuang5186
[考研] 295求调剂 +5 wei-5 2026-03-26 5/250 2026-03-30 08:34 by 探123
[考研] 356求调剂 +3 gysy?s?a 2026-03-28 3/150 2026-03-29 00:33 by 544594351
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭