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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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1142634328

铜虫 (初入文坛)

[求助] 想知道作为结果的.xvg 中的各行的意思,谢谢 已有1人参与

gromacs中通过g_sas命令计算溶剂可及表面积(SAS),输出文件为area.xvg
area.xvg文件的内容:
@    title "Solvent Accessible Surface"
@    xaxis  label "Time (ps)"
@    yaxis  label "Area (nm\S2\N)"
@TYPE xy
@ view 0.15, 0.15, 0.75, 0.85
@ legend on
@ legend box on
@ legend loctype view
@ legend 0.78, 0.8
@ legend length 2
@ s0 legend "Hydrophobic"
@ s1 legend "Hydrophilic"
@ s2 legend "Total"
@ s3 legend "D Gsolv"
         1     16.0803     13.1168     29.1971     83.1227
我想知道上面各行是什么意思,有什么意义?谢谢啊
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awaken2013

铜虫 (小有名气)

。。。你要装了grace才能打开xvg。。
命令:xmgrace -nxy xxx.xvg

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

2楼2015-01-27 22:33:33
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wbf3ng

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
各行的意思,你用grace一看再对照那内容,就知道了,就是图,横纵坐标,线条宽度

[ 发自小木虫客户端 ]
3楼2015-01-27 23:08:43
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1142634328

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by awaken2013 at 2015-01-27 22:33:33
。。。你要装了grace才能打开xvg。。
命令:xmgrace -nxy xxx.xvg

在Ubuntu中我直接双击打开的
4楼2015-01-27 23:12:20
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awaken2013

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by wbf3ng at 2015-01-27 23:08:43
各行的意思,你用grace一看再对照那内容,就知道了,就是图,横纵坐标,线条宽度

这样看怎么看得懂。。这只是原文的一小部分吧?我用xmgrace都画不出来。
5楼2015-01-27 23:14:59
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1142634328

铜虫 (初入文坛)

送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by awaken2013 at 2015-01-27 22:33:33
。。。你要装了grace才能打开xvg。。
命令:xmgrace -nxy xxx.xvg

好的,我试试,谢谢啊
6楼2015-01-27 23:17:08
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1142634328

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by wbf3ng at 2015-01-27 23:08:43
各行的意思,你用grace一看再对照那内容,就知道了,就是图,横纵坐标,线条宽度

关键的关键是我Ubuntu上没有grace,我不会安装grace,如果你会安装,麻烦告诉我下,谢谢
7楼2015-01-27 23:19:51
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wbf3ng

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
1142634328: 金币+10, ★★★很有帮助, 谢谢 2015-01-30 21:08:21
引用回帖:
7楼: Originally posted by 1142634328 at 2015-01-27 23:19:51
关键的关键是我Ubuntu上没有grace,我不会安装grace,如果你会安装,麻烦告诉我下,谢谢...

sudo apt-get install grace,或者在软件中心那里查找安装

[ 发自小木虫客户端 ]
8楼2015-01-27 23:26:42
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赵红霞

铁杆木虫 (著名写手)

引用回帖:
8楼: Originally posted by wbf3ng at 2015-01-27 23:26:42
sudo apt-get install grace,或者在软件中心那里查找安装
...

请问如何查看gromacs里溶剂可及表面(SAS)的计算源代码?
9楼2015-09-15 14:08:46
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wbf3ng

金虫 (小有名气)

引用回帖:
9楼: Originally posted by 赵红霞 at 2015-09-15 14:08:46
请问如何查看gromacs里溶剂可及表面(SAS)的计算源代码?...

gromacs不懂,但是pymol,adt,vmd都有此功能算sas

[ 发自小木虫客户端 ]
10楼2015-09-15 17:56:06
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