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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » 想知道作为结果的.xvg 中的各行的意思，谢谢
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1142634328

铜虫 (初入文坛)

[求助] 想知道作为结果的.xvg 中的各行的意思，谢谢 已有1人参与

gromacs中通过g_sas命令计算溶剂可及表面积（SAS），输出文件为area.xvg
area.xvg文件的内容：
@    title "Solvent Accessible Surface"
@    xaxis  label "Time (ps)"
@    yaxis  label "Area (nm\S2\N)"
@TYPE xy
@ view 0.15, 0.15, 0.75, 0.85
@ legend on
@ legend box on
@ legend loctype view
@ legend 0.78, 0.8
@ legend length 2
@ s0 legend "Hydrophobic"
@ s1 legend "Hydrophilic"
@ s2 legend "Total"
@ s3 legend "D Gsolv"
         1     16.0803     13.1168     29.1971     83.1227
我想知道上面各行是什么意思，有什么意义？谢谢啊
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1楼 2015-01-27 20:54:58
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awaken2013

铜虫 (小有名气)
。。。你要装了grace才能打开xvg。。
命令：xmgrace -nxy xxx.xvg
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1142634328
2楼2015-01-27 22:33:33
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wbf3ng

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
各行的意思，你用grace一看再对照那内容，就知道了，就是图，横纵坐标，线条宽度

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3楼2015-01-27 23:08:43
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1142634328

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by awaken2013 at 2015-01-27 22:33:33
。。。你要装了grace才能打开xvg。。
命令：xmgrace -nxy xxx.xvg

在Ubuntu中我直接双击打开的
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4楼2015-01-27 23:12:20
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awaken2013

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by wbf3ng at 2015-01-27 23:08:43
各行的意思，你用grace一看再对照那内容，就知道了，就是图，横纵坐标，线条宽度

这样看怎么看得懂。。这只是原文的一小部分吧?我用xmgrace都画不出来。
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5楼2015-01-27 23:14:59
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1142634328

铜虫 (初入文坛)
送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by awaken2013 at 2015-01-27 22:33:33
。。。你要装了grace才能打开xvg。。
命令：xmgrace -nxy xxx.xvg

好的，我试试，谢谢啊
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6楼2015-01-27 23:17:08
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1142634328

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by wbf3ng at 2015-01-27 23:08:43
各行的意思，你用grace一看再对照那内容，就知道了，就是图，横纵坐标，线条宽度

关键的关键是我Ubuntu上没有grace，我不会安装grace，如果你会安装，麻烦告诉我下，谢谢
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7楼2015-01-27 23:19:51
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wbf3ng

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
1142634328: 金币+10, ★★★很有帮助, 谢谢 2015-01-30 21:08:21
引用回帖:
7楼: Originally posted by 1142634328 at 2015-01-27 23:19:51
关键的关键是我Ubuntu上没有grace，我不会安装grace，如果你会安装，麻烦告诉我下，谢谢...

sudo apt-get install grace,或者在软件中心那里查找安装

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8楼2015-01-27 23:26:42
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赵红霞

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
8楼: Originally posted by wbf3ng at 2015-01-27 23:26:42
sudo apt-get install grace,或者在软件中心那里查找安装
...

请问如何查看gromacs里溶剂可及表面（SAS）的计算源代码？
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9楼2015-09-15 14:08:46
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wbf3ng

金虫 (小有名气)
引用回帖:
9楼: Originally posted by 赵红霞 at 2015-09-15 14:08:46
请问如何查看gromacs里溶剂可及表面（SAS）的计算源代码？...

gromacs不懂，但是pymol,adt,vmd都有此功能算sas

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10楼2015-09-15 17:56:06
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