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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 材料区 » 晶体 » 晶体解析 » 求助精修一个单核镍晶体的数据，消除B类错误。100金币感谢您的帮助！
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li_junxia6281

木虫 (著名写手)

[求助] 求助精修一个单核镍晶体的数据，消除B类错误。100金币感谢您的帮助！ 已有3人参与

这是一个吡啶-2，6-二甲酸镍的单核配合物（见下图），投了个文章，初审回来说这个数据B类错误没有解决（附件2黄色部分和附件4）。
请牛人帮忙精修，消除B类错误。谢谢。数据见附件3.求助精修一个单核镍晶体的数据，消除B类错误。100金币感谢您的帮助！
7941.PNG


求助精修一个单核镍晶体的数据，消除B类错误。100金币感谢您的帮助！-1
B类错误.PNG
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  • 附件 1 : 7941.JPG
    • 2015-01-24 21:41:58, 63.25 K
  • 附件 2 : B类错误.JPG
    • 2015-01-24 21:42:08, 79.6 K
  • 附件 3 : w7941.rar
    • 2015-01-24 21:44:55, 653.92 K
  • 附件 4 : B15010-cif1-1-Ni-pydc-checkcif.pdf
    • 2015-01-24 21:45:28, 135.67 K

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1楼 2015-01-24 21:45:58
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匿名

用户注销 (知名作家)

精修问题可私信
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li_junxia6281: 回帖置顶 2015-01-28 14:25:15
li_junxia6281: 取消置顶 2015-01-28 14:54:05
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3楼2015-01-25 12:32:08
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匿名

用户注销 (知名作家)

精修问题可私信
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ...
li_junxia6281: 金币+50, ★★★很有帮助, 请把您帮我修好的数据生成一个.tab文件给我吧，这样好做表格。谢谢！ 2015-01-27 01:07:46
li_junxia6281: 金币+50, ★★★★★最佳答案, 文章今天接受了，发在Z. Naturforschung, Section B杂志上的。感谢一路上的帮助！ 2015-05-04 18:21:21
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6楼2015-01-25 16:45:13
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羊倌

至尊木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
ppppppppppppppp
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    • 2015-01-25 22:25:47, 196.2 K
准备架人
10楼2015-01-25 22:25:51
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普通回帖

tzeshyang

铁杆木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
http://pan.baidu.com/s/1dDcV6nR
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2楼2015-01-25 00:50:09
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li_junxia6281

木虫 (著名写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by lich666 at 2015-01-25 12:32:08
吸收校正做做好，也不费劲。
http://pan.baidu.com/s/1sjM8qWt

请问吸收校正怎么做？
菜鸟，见笑了。
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4楼2015-01-25 15:04:06
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匿名

用户注销 (知名作家)

精修问题可私信
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5楼2015-01-25 16:42:29
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我想更懂你29

专家顾问 (文坛精英)
引用回帖:
2楼: Originally posted by tzeshyang at 2015-01-25 00:50:09
http://pan.baidu.com/s/1dDcV6nR

请教一个问题啊，我看结构中水上的氢被你做无序处理了，为何这样处理呢，还有其他的问题我都觉得好解决，这个问题如何让解决呢
PLAT780_ALERT_1_B Coordinates do not Form a Properly Connected Set     Please Do
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以大多数人的努力程度，还轮不到去拼天赋的地步
7楼2015-01-25 21:36:24
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tzeshyang

铁杆木虫 (小有名气)
引用回帖:
7楼: Originally posted by 我想更懂你29 at 2015-01-25 21:36:24
请教一个问题啊，我看结构中水上的氢被你做无序处理了，为何这样处理呢，还有其他的问题我都觉得好解决，这个问题如何让解决呢
PLAT780_ALERT_1_B Coordinates do not Form a Properly Connected Set     Please  ...

无序处理是因为无序的氢都可以参与氢键，也因为无序氢附近都有适合的acceptor, 有两个， 如果不做无序，本来应该要做无序的氢在symmetry generate之后会跟自己形成short contact。我也下载了lich666的解，我猜我们都是这样想的。
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8楼2015-01-25 21:46:51
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tzeshyang

铁杆木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

引用回帖:
7楼: Originally posted by 我想更懂你29 at 2015-01-25 21:36:24
请教一个问题啊，我看结构中水上的氢被你做无序处理了，为何这样处理呢，还有其他的问题我都觉得好解决，这个问题如何让解决呢
PLAT780_ALERT_1_B Coordinates do not Form a Properly Connected Set     Please  ...

至于这个
PLAT780_ALERT_1_B Coordinates do not Form a Properly Connected Set     Please Do

我觉得是水分子离主体太远，有一个c-axis的距离，只要把H2O的z值都加上1，应该就OK了。一个c-axis的距离的判断是我把CIF丢进mercury里再save成res文件后看出来的。
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9楼2015-01-25 21:52:21
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