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月月大可

木虫 (著名写手)

[交流] 测序不一致问题

今天收到基因公司的测序报告,发现问题很大,请各位虫友帮忙分析。
      我通过PCR获得片段A(1.2kb)和B(1.5kb),然后通过重叠PCR(overlap PCR)将两个片段连接起来,再和T载体连接。将A+B+T载体送基因公司测序。拿测序报告和我原有的序列比对发现A和B中都有不少单个碱基不一致的地方,并且在B的后半部分有长达十几bp的缺失。我PCR所使用的酶均为pfu高保真酶。
      请虫友帮忙分析一下,谢谢!!
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月月大可

木虫 (著名写手)

引用回帖:
Originally posted by hulqi at 2008-6-5 23:17:
使用的是双向测序不?测序结果有没有进行连接?

是双向测序,基因公司对测序结果进行了拼接!我比对时用的就是拼接过的序列
6楼2008-06-06 12:54:59
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superarm

金虫 (正式写手)

什么是OVERLAP pcr 啊?
与分子生物学的同仁一起遨游科学的海洋!
2楼2008-06-05 21:59:19
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hulqi

金虫 (正式写手)

使用的是双向测序不?测序结果有没有进行连接?
3楼2008-06-05 23:17:50
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zyk_527

银虫 (小有名气)

是挺奇怪的,假如酶没问题、测序是双向、测序公司的实力没问题的话,俺也想知道原因
4楼2008-06-06 08:55:53
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