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gwq教练

金虫 (初入文坛)

[交流] 有做关于群体感应/信号分子的朋友吗,请教请教

我做群体感应的,要找到某细菌的信号分子基因,但NCBI上很少,请问我该怎么办呢?
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gwq教练(金币+1): 谢谢参与
2楼2015-01-19 12:57:34
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gwq教练(金币+1): 谢谢参与
3楼2015-01-19 13:02:27
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4楼2015-01-19 13:15:13
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gwq教练

金虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by dmbb at 2015-01-19 12:57:34

你做群体感应?
5楼2015-01-19 13:35:44
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titus0805

铁虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
少没关系,从头自己找啊。
找一信号基因,首先确定一个表型(比如菌落边缘光滑),寻找突变菌株,测序找到突变基因,分析是什么蛋白,然后一步一步做下去
6楼2015-01-19 13:36:09
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gwq教练

金虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by tzynew at 2015-01-19 13:02:27

有好的建议吗?
7楼2015-01-19 13:39:57
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gwq教练

金虫 (初入文坛)

引用回帖:
6楼: Originally posted by titus0805 at 2015-01-19 13:36:09
少没关系,从头自己找啊。
找一信号基因,首先确定一个表型(比如菌落边缘光滑),寻找突变菌株,测序找到突变基因,分析是什么蛋白,然后一步一步做下去

冒昧问一下,你是做群体感应吗?怎么感觉你说的跟我要做的的不一样呢
8楼2015-01-19 13:58:19
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zhangbighui

金虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
信号分子发现的也不是很多,首先你得确定你的可验证的目标基因(如抗性基因,毒性因子),对于阳性菌和阴性菌用的自诱导物也不一样。想确定信号分子基因将菌株一系列诱变,加放诱导物检测目标基因表达,然后再对细菌基因组进行高能量测序。
成功,就是成为你想成为的人
9楼2015-01-19 16:46:20
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dehong1573

至尊木虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
如果你做的菌和已经研究过QS的菌有比较高打算同源性,建议直接在你的菌的基因组里面找和已知的菌中QS相关基因,然后参照已有报道做些验证,如果在你菌的基因组中完全找不到和已知QS相关的基因,那么恭喜你,你可能会发现全新的QS相关模式,但是做起来也不是这里一两句能说的清楚的,总之得多看文献!
科学永无止境,只有合作共享才能更好地……
10楼2015-01-22 08:36:20
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