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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 有做关于群体感应/信号分子的朋友吗，请教请教
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gwq教练

金虫 (初入文坛)

[交流] 有做关于群体感应/信号分子的朋友吗，请教请教

我做群体感应的，要找到某细菌的信号分子基因，但NCBI上很少，请问我该怎么办呢？
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1楼 2015-01-19 12:53:35
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dmbb
★
gwq教练(金币+1): 谢谢参与
2楼2015-01-19 12:57:34
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tzynew
★
gwq教练(金币+1): 谢谢参与
3楼2015-01-19 13:02:27
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shenrenren
4楼2015-01-19 13:15:13
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gwq教练

金虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by dmbb at 2015-01-19 12:57:34

你做群体感应？
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5楼2015-01-19 13:35:44
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titus0805

铁虫 (小有名气)
★
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少没关系，从头自己找啊。
找一信号基因，首先确定一个表型（比如菌落边缘光滑），寻找突变菌株，测序找到突变基因，分析是什么蛋白，然后一步一步做下去
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6楼2015-01-19 13:36:09
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gwq教练

金虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by tzynew at 2015-01-19 13:02:27

有好的建议吗？
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7楼2015-01-19 13:39:57
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gwq教练

金虫 (初入文坛)
引用回帖:
6楼: Originally posted by titus0805 at 2015-01-19 13:36:09
少没关系，从头自己找啊。
找一信号基因，首先确定一个表型（比如菌落边缘光滑），寻找突变菌株，测序找到突变基因，分析是什么蛋白，然后一步一步做下去

冒昧问一下，你是做群体感应吗？怎么感觉你说的跟我要做的的不一样呢
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8楼2015-01-19 13:58:19
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zhangbighui

金虫 (正式写手)
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信号分子发现的也不是很多，首先你得确定你的可验证的目标基因（如抗性基因，毒性因子），对于阳性菌和阴性菌用的自诱导物也不一样。想确定信号分子基因将菌株一系列诱变，加放诱导物检测目标基因表达，然后再对细菌基因组进行高能量测序。
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成功，就是成为你想成为的人
9楼2015-01-19 16:46:20
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dehong1573

至尊木虫 (正式写手)
★
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如果你做的菌和已经研究过QS的菌有比较高打算同源性，建议直接在你的菌的基因组里面找和已知的菌中QS相关基因，然后参照已有报道做些验证，如果在你菌的基因组中完全找不到和已知QS相关的基因，那么恭喜你，你可能会发现全新的QS相关模式，但是做起来也不是这里一两句能说的清楚的，总之得多看文献！
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科学永无止境,只有合作共享才能更好地……
10楼2015-01-22 08:36:20
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