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52nana

铁虫 (小有名气)

[交流] 【求助】问个结构优化坐标的问题

最近看一些计算的文章中通常有这么一句话:
“为了得到稳定精确的计算结果,我们先优化晶胞的结构,得到晶胞参数后,再优化其内坐标,在此基础上再计算单点能。”

问题是:
“我们”到底是怎么做到“优化内坐标”的?
真的可以得到稳定精确的计算结果么?


[ Last edited by freshgirl on 2009-6-23 at 14:49 ]
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52nana

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by neweroica at 2008-6-3 18:29:


你说的应该是周期性结构。对于周期性结构的几何构型优化,需要同时优化晶胞参数和晶胞内的原子位置。

因此,你提到的“优化其内坐标” 就是指:固定晶胞参数,去优化晶胞内的各原子位置。

谢谢!
再多问一句:你说的“需要同时优化晶胞参数和晶胞内的原子位置。”,后面怎么要“固定晶胞参数,去优化晶胞内的各原子位置。”,这样不是前后矛盾么?
3楼2008-06-03 19:09:48
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neweroica

木虫 (著名写手)

★ ★
zdhlover(金币+2,VIP+0):谢谢 2-15 18:10
引用回帖:
Originally posted by 52nana at 2008-6-3 17:59:
最近看一些计算的文章中通常有这么一句话:
“为了得到稳定精确的计算结果,我们先优化晶胞的结构,得到晶胞参数后,再优化其内坐标,在此基础上再计算单点能。”

问题是:
“我们”到底是怎么做到“ ...

你说的应该是周期性结构。对于周期性结构的几何构型优化,需要同时优化晶胞参数和晶胞内的原子位置。

因此,你提到的“优化其内坐标” 就是指:固定晶胞参数,去优化晶胞内的各原子位置。
Simpler, stronger, more tolerant
2楼2008-06-03 18:29:13
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neweroica

木虫 (著名写手)

★ ★
zdhlover(金币+2,VIP+0):谢谢 2-15 18:10
引用回帖:
Originally posted by 52nana at 2008-6-3 19:09:


谢谢!
再多问一句:你说的“需要同时优化晶胞参数和晶胞内的原子位置。”,后面怎么要“固定晶胞参数,去优化晶胞内的各原子位置。”,这样不是前后矛盾么?

不矛盾。
一般都是分两步做:

1. 固定晶胞内原子位置,先只优化晶胞参数。
2. 固定第1步优化好的晶胞参数,优化晶胞内原子位置。
3. 重复步骤1和2,直到满足需要的精度。

注:可以颠倒步骤1和2,应视具体情况而定:如果晶胞参数的初始猜测较好,则先优化原子坐标。如果原子位置的初始猜测较好,则先优化晶胞参数。
Simpler, stronger, more tolerant
4楼2008-06-03 20:25:34
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52nana

铁虫 (小有名气)

谢谢neweroica
不知道是不是结构优化都要这么做呢?
在Castep中结构优化时有一个选项Optimize cell,这个选项能不能实现同时优化晶胞参数和晶胞内的原子位置的目的?
5楼2008-06-04 09:55:14
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