应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » 【求助】问个结构优化坐标的问题
131/2返回列表12下一页
查看: 753  |  回复: 12
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前主题已经存档。

52nana

铁虫 (小有名气)

[交流] 【求助】问个结构优化坐标的问题

最近看一些计算的文章中通常有这么一句话：
“为了得到稳定精确的计算结果，我们先优化晶胞的结构，得到晶胞参数后，再优化其内坐标，在此基础上再计算单点能。”

问题是：
“我们”到底是怎么做到“优化内坐标”的？
真的可以得到稳定精确的计算结果么？

[ Last edited by freshgirl on 2009-6-23 at 14:49 ]
回复此楼

» 猜你喜欢
1楼 2008-06-03 17:59:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

neweroica

木虫 (著名写手)
★ ★
zdhlover(金币+2,VIP+0):谢谢 2-15 18:10
引用回帖:
Originally posted by 52nana at 2008-6-3 17:59:
最近看一些计算的文章中通常有这么一句话：
“为了得到稳定精确的计算结果，我们先优化晶胞的结构，得到晶胞参数后，再优化其内坐标，在此基础上再计算单点能。”

问题是：
“我们”到底是怎么做到“ ...

你说的应该是周期性结构。对于周期性结构的几何构型优化，需要同时优化晶胞参数和晶胞内的原子位置。

因此，你提到的“优化其内坐标” 就是指：固定晶胞参数，去优化晶胞内的各原子位置。
赞一下(10人) 回复此楼
Simpler, stronger, more tolerant
2楼2008-06-03 18:29:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

52nana

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by neweroica at 2008-6-3 18:29:


你说的应该是周期性结构。对于周期性结构的几何构型优化，需要同时优化晶胞参数和晶胞内的原子位置。

因此，你提到的“优化其内坐标” 就是指：固定晶胞参数，去优化晶胞内的各原子位置。

谢谢！
再多问一句：你说的“需要同时优化晶胞参数和晶胞内的原子位置。”，后面怎么要“固定晶胞参数，去优化晶胞内的各原子位置。”，这样不是前后矛盾么？
赞一下 回复此楼
3楼2008-06-03 19:09:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

neweroica

木虫 (著名写手)
★ ★
zdhlover(金币+2,VIP+0):谢谢 2-15 18:10
引用回帖:
Originally posted by 52nana at 2008-6-3 19:09:


谢谢！
再多问一句：你说的“需要同时优化晶胞参数和晶胞内的原子位置。”，后面怎么要“固定晶胞参数，去优化晶胞内的各原子位置。”，这样不是前后矛盾么？

不矛盾。
一般都是分两步做：

1. 固定晶胞内原子位置，先只优化晶胞参数。
2. 固定第1步优化好的晶胞参数，优化晶胞内原子位置。
3. 重复步骤1和2，直到满足需要的精度。

注：可以颠倒步骤1和2，应视具体情况而定：如果晶胞参数的初始猜测较好，则先优化原子坐标。如果原子位置的初始猜测较好，则先优化晶胞参数。
赞一下(10人) 回复此楼
Simpler, stronger, more tolerant
4楼2008-06-03 20:25:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

52nana

铁虫 (小有名气)
谢谢neweroica
不知道是不是结构优化都要这么做呢？
在Castep中结构优化时有一个选项Optimize cell，这个选项能不能实现同时优化晶胞参数和晶胞内的原子位置的目的？
赞一下 回复此楼
5楼2008-06-04 09:55:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

neweroica

木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by 52nana at 2008-6-4 09:55:
谢谢neweroica
不知道是不是结构优化都要这么做呢？
在Castep中结构优化时有一个选项Optimize cell，这个选项能不能实现同时优化晶胞参数和晶胞内的原子位置的目的？

没用过Castep，所以无法回答。
赞一下 回复此楼
Simpler, stronger, more tolerant
6楼2008-06-04 16:53:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

52nana

铁虫 (小有名气)
还是很感谢你
回复此楼
7楼2008-06-04 19:32:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

spur

金虫 (正式写手)
★ ★
zdhlover(金币+2,VIP+0):谢谢 2-15 18:10
zdhlover(金币+2,VIP+0):谢谢 2-15 18:10
zdhlover(金币+2,VIP+0):谢谢 2-15 18:10
zdhlover(金币+2,VIP+0):谢谢 2-15 18:10
zdhlover(金币+2,VIP+0):谢谢 2-15 18:10
zdhlover(金币+2,VIP+0):谢谢 2-15 18:10
zdhlover(金币+2,VIP+0):谢谢 2-15 18:10
zdhlover(金币-12,VIP+0):呵呵，不好意思，加多了 2-16 13:09
在castep中一般不需要进行两步来优化，程序自动选择两步优化同时进行。既优化晶胞参数又优化原子坐标。而所谓的内坐标，我个人的理解是“分数坐标”的另外一种说法而已。在vasp中是可以把这两步分开进行的。
赞一下(80人) 回复此楼
8楼2008-06-04 21:24:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wyl04

金虫 (小有名气)
★
zdhlover(金币+1,VIP+0):xiexie 2-15 18:11
就是先优化晶胞，在计算分数坐标。
两步计算比一次性计算更有效。
赞一下(10人) 回复此楼
9楼2008-06-04 23:31:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

puchunying

金虫 (小有名气)
★
zdhlover(金币+1,VIP+0):谢谢 2-15 18:11
在modify里constrain固定晶格参数，然后在做CASTEP理的优化，是对结构中的原子优化，否则就是都优化
赞一下(10人) 回复此楼
10楼2009-02-15 10:56:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 52nana 的主题更新
131/2返回列表12下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 311求调剂 +12 冬十三 2026-03-15 13/650 2026-03-21 19:07 by ColorlessPI
[考研] 材料求调剂 +4 @taotao 2026-03-21 4/200 2026-03-21 18:52 by 学员8dgXkO
[考研] 初试 317 +6 半拉月丙 2026-03-20 6/300 2026-03-21 18:27 by 学员8dgXkO
[考研] 297求调剂 +11 戏精丹丹丹 2026-03-17 12/600 2026-03-21 17:47 by ColorlessPI
[考研] 286求调剂 +8 Faune 2026-03-21 8/400 2026-03-21 17:16 by 学员8dgXkO
[考研] 268求调剂 +9 简单点0 2026-03-17 9/450 2026-03-21 15:37 by lature00
[考研] 332求调剂 +3 凤凰院丁真 2026-03-20 3/150 2026-03-21 10:27 by luoyongfeng
[考研] 265求调剂 +3 Jack?k?y 2026-03-17 3/150 2026-03-21 03:17 by JourneyLucky
[考研] 华东师范大学-071000生物学-293分-求调剂 +3 研究生何瑶明 2026-03-18 3/150 2026-03-21 01:30 by JourneyLucky
[考研] 南京大学化学376求调剂 +3 hisfailed 2026-03-19 6/300 2026-03-20 23:43 by hisfailed
[考研] 中南大学化学学硕337求调剂 +3 niko- 2026-03-19 6/300 2026-03-20 21:58 by luoyongfeng
[考研] 290求调剂 +7 ^O^乜 2026-03-19 7/350 2026-03-20 21:43 by JourneyLucky
[考研] 353求调剂 +3 拉钩不许变 2026-03-20 3/150 2026-03-20 19:56 by JourneyLucky
[考研] 一志愿中国海洋大学，生物学，301分，求调剂 +5 1孙悟空 2026-03-17 6/300 2026-03-19 23:46 by zcl123
[考研] 一志愿福大288有机化学，求调剂 +3 小木虫200408204 2026-03-18 3/150 2026-03-19 13:31 by houyaoxu
[考研] 收复试调剂生 +4 雨后秋荷 2026-03-18 4/200 2026-03-18 14:16 by elevennnne
[考研] 考研调剂 +3 淇ya_~ 2026-03-17 5/250 2026-03-17 09:25 by Winj1e
[考研] 一志愿，福州大学材料专硕339分求调剂 +3 木子momo青争 2026-03-15 3/150 2026-03-17 07:52 by laoshidan
[考研] [导师推荐]西南科技大学国防/材料导师推荐 +3 尖角小荷 2026-03-16 6/300 2026-03-16 23:21 by 尖角小荷
[考研] 318求调剂 +3 Yanyali 2026-03-15 3/150 2026-03-16 16:41 by houyaoxu
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭