应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » 【求助】问个结构优化坐标的问题
131/2返回列表12下一页
查看: 994  |  回复: 12
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前主题已经存档。

52nana

铁虫 (小有名气)

[交流] 【求助】问个结构优化坐标的问题

最近看一些计算的文章中通常有这么一句话：
“为了得到稳定精确的计算结果，我们先优化晶胞的结构，得到晶胞参数后，再优化其内坐标，在此基础上再计算单点能。”

问题是：
“我们”到底是怎么做到“优化内坐标”的？
真的可以得到稳定精确的计算结果么？

[ Last edited by freshgirl on 2009-6-23 at 14:49 ]
回复此楼

» 猜你喜欢
1楼 2008-06-03 17:59:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

neweroica

木虫 (著名写手)
★ ★
zdhlover(金币+2,VIP+0):谢谢 2-15 18:10
引用回帖:
Originally posted by 52nana at 2008-6-3 17:59:
最近看一些计算的文章中通常有这么一句话：
“为了得到稳定精确的计算结果，我们先优化晶胞的结构，得到晶胞参数后，再优化其内坐标，在此基础上再计算单点能。”

问题是：
“我们”到底是怎么做到“ ...

你说的应该是周期性结构。对于周期性结构的几何构型优化，需要同时优化晶胞参数和晶胞内的原子位置。

因此，你提到的“优化其内坐标” 就是指：固定晶胞参数，去优化晶胞内的各原子位置。
赞一下(10人) 回复此楼
Simpler, stronger, more tolerant
2楼2008-06-03 18:29:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

52nana

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by neweroica at 2008-6-3 18:29:


你说的应该是周期性结构。对于周期性结构的几何构型优化，需要同时优化晶胞参数和晶胞内的原子位置。

因此，你提到的“优化其内坐标” 就是指：固定晶胞参数，去优化晶胞内的各原子位置。

谢谢！
再多问一句：你说的“需要同时优化晶胞参数和晶胞内的原子位置。”，后面怎么要“固定晶胞参数，去优化晶胞内的各原子位置。”，这样不是前后矛盾么？
赞一下 回复此楼
3楼2008-06-03 19:09:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

neweroica

木虫 (著名写手)
★ ★
zdhlover(金币+2,VIP+0):谢谢 2-15 18:10
引用回帖:
Originally posted by 52nana at 2008-6-3 19:09:


谢谢！
再多问一句：你说的“需要同时优化晶胞参数和晶胞内的原子位置。”，后面怎么要“固定晶胞参数，去优化晶胞内的各原子位置。”，这样不是前后矛盾么？

不矛盾。
一般都是分两步做：

1. 固定晶胞内原子位置，先只优化晶胞参数。
2. 固定第1步优化好的晶胞参数，优化晶胞内原子位置。
3. 重复步骤1和2，直到满足需要的精度。

注：可以颠倒步骤1和2，应视具体情况而定：如果晶胞参数的初始猜测较好，则先优化原子坐标。如果原子位置的初始猜测较好，则先优化晶胞参数。
赞一下(10人) 回复此楼
Simpler, stronger, more tolerant
4楼2008-06-03 20:25:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

52nana

铁虫 (小有名气)
谢谢neweroica
不知道是不是结构优化都要这么做呢？
在Castep中结构优化时有一个选项Optimize cell，这个选项能不能实现同时优化晶胞参数和晶胞内的原子位置的目的？
赞一下 回复此楼
5楼2008-06-04 09:55:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

neweroica

木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by 52nana at 2008-6-4 09:55:
谢谢neweroica
不知道是不是结构优化都要这么做呢？
在Castep中结构优化时有一个选项Optimize cell，这个选项能不能实现同时优化晶胞参数和晶胞内的原子位置的目的？

没用过Castep，所以无法回答。
赞一下 回复此楼
Simpler, stronger, more tolerant
6楼2008-06-04 16:53:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

52nana

铁虫 (小有名气)
还是很感谢你
回复此楼
7楼2008-06-04 19:32:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

spur

金虫 (正式写手)
★ ★
zdhlover(金币+2,VIP+0):谢谢 2-15 18:10
zdhlover(金币+2,VIP+0):谢谢 2-15 18:10
zdhlover(金币+2,VIP+0):谢谢 2-15 18:10
zdhlover(金币+2,VIP+0):谢谢 2-15 18:10
zdhlover(金币+2,VIP+0):谢谢 2-15 18:10
zdhlover(金币+2,VIP+0):谢谢 2-15 18:10
zdhlover(金币+2,VIP+0):谢谢 2-15 18:10
zdhlover(金币-12,VIP+0):呵呵，不好意思，加多了 2-16 13:09
在castep中一般不需要进行两步来优化，程序自动选择两步优化同时进行。既优化晶胞参数又优化原子坐标。而所谓的内坐标，我个人的理解是“分数坐标”的另外一种说法而已。在vasp中是可以把这两步分开进行的。
赞一下(80人) 回复此楼
8楼2008-06-04 21:24:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wyl04

金虫 (小有名气)
★
zdhlover(金币+1,VIP+0):xiexie 2-15 18:11
就是先优化晶胞，在计算分数坐标。
两步计算比一次性计算更有效。
赞一下(10人) 回复此楼
9楼2008-06-04 23:31:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

puchunying

金虫 (小有名气)
★
zdhlover(金币+1,VIP+0):谢谢 2-15 18:11
在modify里constrain固定晶格参数，然后在做CASTEP理的优化，是对结构中的原子优化，否则就是都优化
赞一下(10人) 回复此楼
10楼2009-02-15 10:56:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 52nana 的主题更新
131/2返回列表12下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 欢迎发来filecode的Mz6后的代码验证其规律 +46 医学老男孩 2026-08-13 102/5100 2026-08-18 14:41 by qinwangshen
[基金申请] 重要消息，中午系统在维护 +5 yuleib84 2026-08-18 6/300 2026-08-18 14:34 by 阿荣喝酒
[基金申请] 时间戳又变了8-15 +14 archvillain 2026-08-15 26/1300 2026-08-18 13:37 by phantomgost
[硕博家园] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 KZyU1THERRVo 2026-08-18 4/200 2026-08-18 13:28 by vHWVV9D5Deb5
[基金申请] 今天维护系统维护 祝所有人 高中 +8 gjjjzhong 2026-08-18 9/450 2026-08-18 13:01 by 家与远方
[基金申请] 哪位老哥知道今年的国自然具体哪一天放榜？ +13 Ldrop2023 2026-08-13 16/800 2026-08-18 12:25 by 淀粉搬运工
[基金申请] 2027广东省杰青 +3 奶牛小黑 2026-08-15 8/400 2026-08-18 11:47 by gltch
[基金申请] 快农历七夕节了，轻松一下，男人悄悄话，女施主请不要进来。 +4 Tide man 2026-08-14 5/250 2026-08-18 11:35 by Tide man
[论文投稿] 投稿咨询 +4 wwm09 2026-08-17 5/250 2026-08-18 11:25 by 無關想念
[基金申请] 93BebMhtakh前后11位开头都是大写 +4 且听虎啸 2026-08-17 5/250 2026-08-18 00:49 by 蔡棒棒菂
[基金申请] 感觉是下周放榜了 +6 angus9576 2026-08-17 11/550 2026-08-17 23:57 by angus9576
[基金申请] filecode=后面第一个是大写字母 +8 wangze12014 2026-08-14 10/500 2026-08-17 17:05 by xter9665
[基金申请] 今天系统多次维护，明天很可能放榜！ +8 zju2000 2026-08-16 9/450 2026-08-17 12:20 by lmz0216
[基金申请] 咱们一起用铁证分析2026国家社科基金中标与否 +7 启萌科技 2026-08-12 26/1300 2026-08-16 12:35 by 启萌科技
[精细化工] 招聘 金属平磨液，抛光液研发工程师 +3 小天0311 2026-08-14 3/150 2026-08-16 07:31 by H9PLUS
[基金申请] 各位道友，我要去昆明玩几天，回来见。 +7 Tide man 2026-08-14 8/400 2026-08-15 01:11 by arzu_hma
[基金申请] 是这周出结果还是下周出结果？ +4 yuleib84 2026-08-11 4/200 2026-08-14 23:05 by lfy8008
[基金申请] 不应该看fileCode +7 且听虎啸 2026-08-12 9/450 2026-08-13 14:27 by flydreamws
[基金申请] Filecode 又变了，巨变 +3 WH3796 2026-08-12 4/200 2026-08-13 14:13 by 小木虫6752397
[基金申请] 2019年青年基金涵评意见，大家看看几个A，几个B? +11 Tide man 2026-08-11 11/550 2026-08-13 07:35 by 撸猫猫
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭