应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » 怎样得到吸附结构的分子密度分布曲线
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
101/1返回列表
查看: 2975  |  回复: 9
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

wangfei天空

铜虫 (小有名气)

[求助] 怎样得到吸附结构的分子密度分布曲线

用MS得到的甲烷在石墨层间的吸附结构，怎样获得右边的密度分布曲线呢？
谢谢大家

怎样得到吸附结构的分子密度分布曲线
L44A61T[931`MNZ]LUTZCJC.png
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2015-01-15 15:21:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
月只蓝: 应助指数+1 2015-01-15 20:43:24
wangfei天空(月只蓝代发): 金币+3, 鼓励交流 2015-01-15 20:43:27
wangfei天空: 金币+20, ★★★很有帮助, 帮助了大半 2015-01-15 21:11:57
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=7658843
我之前回过一个类似的帖子
是forcite 的concentration profile功能
赞一下 回复此楼
#有问题发论坛，不接受私聊#爱晶体，爱MaterialsStudio#MS专辑点击右边#http://emuch.net/taotie/41673.html#物性数据#http://webbook.nist.gov/chemistry/#
2楼2015-01-15 15:49:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wangfei天空

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by pigrass at 2015-01-15 15:49:34
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=7658843
我之前回过一个类似的帖子
是forcite 的concentration profile功能

谢谢老师的耐心指点

失败的原因是这个不是周期性

但是之前一个有个同事说，MS默认周期性边界

请问这个又怎么设置呢，还是我的模型本身的问题
怎样得到吸附结构的分子密度分布曲线-1
Z8TJ]5`(0J}O8J2Y2SWL0LC.jpg
赞一下 回复此楼
3楼2015-01-15 16:47:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪
★
wangfei天空(月只蓝代发): 金币+1, 鼓励交流 2015-01-15 20:43:34
引用回帖:
3楼: Originally posted by wangfei天空 at 2015-01-15 16:47:21
谢谢老师的耐心指点

失败的原因是这个不是周期性

但是之前一个有个同事说，MS默认周期性边界

请问这个又怎么设置呢，还是我的模型本身的问题

Z8TJ]5`(0J}O8J2Y2SWL0LC.jpg
...

模型必须要是晶体、无定型晶胞等周期性结构，不然程序不知道从哪里开始计算

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
赞一下 回复此楼
#有问题发论坛，不接受私聊#爱晶体，爱MaterialsStudio#MS专辑点击右边#http://emuch.net/taotie/41673.html#物性数据#http://webbook.nist.gov/chemistry/#
4楼2015-01-15 19:54:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wangfei天空

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by pigrass at 2015-01-15 19:54:45
模型必须要是晶体、无定型晶胞等周期性结构，不然程序不知道从哪里开始计算
...

应该是不能make p1噶
赞一下 回复此楼
5楼2015-01-15 21:10:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪
引用回帖:
5楼: Originally posted by wangfei天空 at 2015-01-15 21:10:46
应该是不能make p1噶...

计算concentration profile的时候无所谓有没有make P1，只要保证是周期性结构就行
赞一下 回复此楼
#有问题发论坛，不接受私聊#爱晶体，爱MaterialsStudio#MS专辑点击右边#http://emuch.net/taotie/41673.html#物性数据#http://webbook.nist.gov/chemistry/#
6楼2015-01-16 09:09:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wangfei天空

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by pigrass at 2015-01-16 09:09:31
计算concentration profile的时候无所谓有没有make P1，只要保证是周期性结构就行...

昨天尝试了不make p1跑，  结果确实还是出错了

请问怎样保证周期性呢
赞一下 回复此楼
7楼2015-01-16 15:42:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wangfei天空

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by pigrass at 2015-01-16 09:09:31
计算concentration profile的时候无所谓有没有make P1，只要保证是周期性结构就行...

吸附剂结构是由MS自带单晶建立的超晶胞  supercell这个好像是默认的周期性边界   我是先给吸附剂结构 两种吸附质都分配了力场再Sorption的  吸附过程中没有再计算力场  是这个问题吗  
老师您说的保证，请问怎样保证呢
赞一下 回复此楼
8楼2015-01-16 15:51:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wangfei天空

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by pigrass at 2015-01-16 09:09:31
计算concentration profile的时候无所谓有没有make P1，只要保证是周期性结构就行...

有个怪现象：我跑1000步的吸附结构可以用concentration profile   但是跑20000000步的吸附结构却不能用了
赞一下 回复此楼
9楼2015-01-16 16:00:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪
引用回帖:
9楼: Originally posted by wangfei天空 at 2015-01-16 16:00:15
有个怪现象：我跑1000步的吸附结构可以用concentration profile   但是跑20000000步的吸附结构却不能用了...

能不能把dynamic后的xtd文件发给我 我试试看 1195844198@qq.com 是要求孔洞中小分子的分布吧？
赞一下 回复此楼
#有问题发论坛，不接受私聊#爱晶体，爱MaterialsStudio#MS专辑点击右边#http://emuch.net/taotie/41673.html#物性数据#http://webbook.nist.gov/chemistry/#
10楼2015-01-16 16:23:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 wangfei天空 的主题更新
101/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 材料科学与工程调剂 +12 深V宿舍吧 2026-03-30 13/650 2026-03-31 11:26 by 不吃魚的貓
[考研] 一志愿大连理工大学，机械工程学硕，341 +3 西瓜田的守望者 2026-03-30 3/150 2026-03-31 11:08 by asdfzly
[考研] 总分322求生物学/生化与分子/生物信息学相关调剂 +6 星沉uu 2026-03-26 7/350 2026-03-31 10:19 by GdShizy
[考研] 308求调剂 +8 墨墨漠 2026-03-25 8/400 2026-03-31 09:15 by dgd2013
[考研] 材料求调剂 一志愿哈工大总分298分，前三科223分 +10 dongfang59 2026-03-27 10/500 2026-03-30 23:42 by 果果妈咪
[考研] 332求调剂 +14 032500 2026-03-25 14/700 2026-03-30 20:03 by 无际的草原
[考研] 322求调剂 +10 宋明欣 2026-03-27 10/500 2026-03-30 18:47 by 544594351
[考研] 0703 化学 求调剂，一志愿山东大学 342 分 +7 Shern—- 2026-03-28 7/350 2026-03-30 16:31 by nothing投稿中
[考研] 085701求调剂初试286分 +5 secret0328 2026-03-28 5/250 2026-03-30 12:54 by fangnagu
[考研] 材料与化工272求调剂 +21 阿斯蒂芬2004 2026-03-28 21/1050 2026-03-30 10:52 by 晴空210210
[考研] 318一志愿吉林大学生物与医药 求调剂 +5 笃行致远. 2026-03-28 5/250 2026-03-30 06:56 by ilovexiaobin
[考研] 一志愿南航 335分 | 0856 | GPA 4.07 | 有科研经历 +8 cccchenso 2026-03-29 8/400 2026-03-29 23:53 by 我是小康
[考研] 一志愿南昌大学324求调剂 +5 hanamiko 2026-03-29 5/250 2026-03-29 16:46 by 学员8dgXkO
[考研] 数一英一271专硕（085401）求调剂，可跨 +7 前行必有光 2026-03-28 8/400 2026-03-28 23:22 by 小木虫tim
[考研] 331环境科学与工程求调剂 +3 熠然好运气 2026-03-27 3/150 2026-03-28 04:11 by fmesaito
[考研] 315分求调剂 +7 26考研上岸版26 2026-03-26 7/350 2026-03-28 04:05 by fmesaito
[考研] 一志愿上海理工能源动力（085800）310分求调剂 +3 zhangmingc 2026-03-27 4/200 2026-03-27 19:01 by 给你你注意休息
[考研] 315调剂 +4 0860求调剂 2026-03-26 5/250 2026-03-27 11:23 by wangjy2002
[考研] 314求调剂 +3 溪云珂 2026-03-26 3/150 2026-03-27 11:20 by sanrepian
[考研] 309求调剂 +4 gajsj 2026-03-25 5/250 2026-03-26 00:27 by Dyhoer
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭