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moshangchenx

金虫 (正式写手)

[求助] 目的片段一端是粘性末端,一端是平末端与相应载体的连接如何提高效率?急!已有12人参与

我最近在做一个片段与载体的连接构建一个质粒,连了很多次都没连上.
具体如下:我的目的片段一端是粘性末端(Spe I 酶切位点),一端是平末端(SMA I 酶切位点).片段是PCR后连在T载体上测序正确,双酶切效果可以切出两条相应大小的片段.载体是pDBLeu,内含Spe I 与SMA I 酶切位点.其双酶切出的片段与未酶切的片段有电泳大小的区别.目的片段与载体我都双酶切后进行胶回收用去离子水溶解.回收产物电泳可看到模糊条带.
我做了十几次片段与载体不同浓度的连接,Takara Solutiuon I 、TIANGEN的T4DNA连接酶进行16度过夜连接以及用PCR仪进行过夜变温连接,用未酶切的pDBLeu质粒做阳性对照.结果,阳性对照的平板上每次都产生很多菌落,但做连接的板上一个菌落都没有.载体双酶切后片段长9800多bp,目标片段为1800多bp。
做了很多次了都如此,都快做的没信心做下去了,有哪个大哥大姐给我一些建设性意见吗?多谢了!!!
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科研无止境,我心成蹉跎
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moshangchenx

金虫 (正式写手)

引用回帖:
17楼: Originally posted by yangzhx at 2015-01-13 16:49:34
可能是跑胶染料的问题,不知你用的什么染料。染料能和DNA结合,影响连接效率。建议更换染料或者减少加入的量。

我用的是EB
科研无止境,我心成蹉跎
21楼2015-01-14 19:22:58
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moshangchenx

金虫 (正式写手)

胶回收的时候先用AXYGEN的回收试剂盒,但效果不大好,之后采用冷冻离心经酚-氯仿抽提进行胶回收的
科研无止境,我心成蹉跎
2楼2015-01-12 09:08:50
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moshangchenx

金虫 (正式写手)

也进行过4度过夜连接,但也没长,做了快两个月了,真心快崩溃了..........
科研无止境,我心成蹉跎
3楼2015-01-12 09:18:38
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晞朔

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
既然这么难做,为什么不试试换酶切位点呢?
4楼2015-01-12 10:00:14
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