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moshangchenx

金虫 (正式写手)

[求助] 目的片段一端是粘性末端,一端是平末端与相应载体的连接如何提高效率?急!已有12人参与

我最近在做一个片段与载体的连接构建一个质粒,连了很多次都没连上.
具体如下:我的目的片段一端是粘性末端(Spe I 酶切位点),一端是平末端(SMA I 酶切位点).片段是PCR后连在T载体上测序正确,双酶切效果可以切出两条相应大小的片段.载体是pDBLeu,内含Spe I 与SMA I 酶切位点.其双酶切出的片段与未酶切的片段有电泳大小的区别.目的片段与载体我都双酶切后进行胶回收用去离子水溶解.回收产物电泳可看到模糊条带.
我做了十几次片段与载体不同浓度的连接,Takara Solutiuon I 、TIANGEN的T4DNA连接酶进行16度过夜连接以及用PCR仪进行过夜变温连接,用未酶切的pDBLeu质粒做阳性对照.结果,阳性对照的平板上每次都产生很多菌落,但做连接的板上一个菌落都没有.载体双酶切后片段长9800多bp,目标片段为1800多bp。
做了很多次了都如此,都快做的没信心做下去了,有哪个大哥大姐给我一些建设性意见吗?多谢了!!!
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科研无止境,我心成蹉跎
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781055707

木虫 (著名写手)

★ ★
西门吹雪170: 金币+2, 鼓励回帖交流 2015-01-13 22:30:58
引用回帖:
10楼: Originally posted by moshangchenx at 2015-01-12 16:37:53
谢谢您的应助!新的连接酶昨天也用过,但还是没做出来!我还有个问题想问一下,我的载体长9903bp,目标片段是1863bp,用的胶回收试剂盒是回收70bp-10kb的,但是回收的小片段很清楚但大片段是弥散的,所以采用的酚氯 ...

9000BP的我用试剂盒也收过,没什么问题。可能是你原本载体的感受态(中的DNA酶)对你载体质粒的影响,就会使你酶切后的质粒无法与目的片段链接,你胶回收后的载体浓度时多少,是不是10几NG?载体的感受态是什么?建议将质粒转化进DH5A中,在重提质粒,在连接过。新的连接酶连接其他质粒能连上的吧?
采菊东篱下,悠然见南山。
11楼2015-01-12 17:28:20
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moshangchenx

金虫 (正式写手)

胶回收的时候先用AXYGEN的回收试剂盒,但效果不大好,之后采用冷冻离心经酚-氯仿抽提进行胶回收的
科研无止境,我心成蹉跎
2楼2015-01-12 09:08:50
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moshangchenx

金虫 (正式写手)

也进行过4度过夜连接,但也没长,做了快两个月了,真心快崩溃了..........
科研无止境,我心成蹉跎
3楼2015-01-12 09:18:38
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晞朔

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
既然这么难做,为什么不试试换酶切位点呢?
4楼2015-01-12 10:00:14
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