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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 计算模拟 » 其他 » MS吸附能计算的问题
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fentuo1203

新虫 (初入文坛)

[交流] MS吸附能计算的问题

各位大神，本人用MS的CASTEP模块做吸附能计算，大概过程是：
1、根据FINDIT的数据构建的晶胞模型，没有做结构优化，因为优化后的参数跟实验值相差太大，所以没做优化
2、切面，选取的是（003）面，没有建立超晶胞，第一层和最低层原子是一样的。随后对该Slab进行了结构优化。计算了单点能。
3、计算了被吸附小分子的能量，直接建立分子结构优化后进行的单点能计算。
4、将优化后的小分子加到第二步优化后的Slab上，固定下面一半，上面一半弛豫。
定义吸附能=系统能量-之前单个的能量，根据这个计算得到的吸附能是正值，相当于该反应是吸热反应，这应该是不可能的。
备注：我计算的是NiCl2晶体表面的吸附。

请各位大神不吝赐教，本人感激不尽！
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1楼 2015-01-11 23:30:23
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月只蓝

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28楼: Originally posted by fentuo1203 at 2015-01-21 10:40:49
上下表面原子不一致：我的意思是最上层原子和最下层原子不一样，我看了有些帖子说是化合物晶体在表面能计算的时候切面的话要使最上层和最下层原子是一样的。然后我也想计算一下表面能，但是我无法既满足最上层与最 ...

1. 但是一优化就改变了空间群，而且晶胞参数也会随着改变，是不是应该固定表面的晶胞参数和角度然后在进行优化。如果需要，怎么固定呢。

回复：优化的时候，不选择优化cell，晶格参数就不会变了，而且该slab是从优化后的晶胞切出来的，优化的时候不需要优化晶格常数了，即不需要勾选 optimize cell。
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29楼2015-01-21 10:52:29
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月只蓝

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30楼: Originally posted by fentuo1203 at 2015-01-21 11:08:04
嗯，我没有选择optimize cell，但晶格参数也确实变了，我也摸不着头脑了。不知道是不是有些帖子说的极性表面的原因。下面三张图是（101）面切出来的样子和优化后的样子，优化后由于空间群的改变，出现了两种表现形 ...

按理说不选择 优化cell，晶格常数不会变的。
如果这个问题解决不了，表面优化这一步就不要做了吧，做下面的吸附看看。
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李大哥110
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31楼2015-01-21 11:16:36
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月只蓝

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32楼: Originally posted by fentuo1203 at 2015-01-21 11:23:18
表面结构不优化，直接做吸附可以吗？...

做先来看看。一般差别不会很大，如果以后表面优化可以做，你可以比较一下两者计算结果的差别。
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33楼2015-01-21 11:25:49
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月只蓝

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34楼: Originally posted by fentuo1203 at 2015-01-22 15:18:50
版主，吸附能是体系的能量减去各自的能量，这里是能量是带绝对值还是不带？比如我吸附后体系能量-1000，吸附前基底能量-900，小分子能量-110，那吸附能是-10还是10呢？...

吸附能是 -1000- （-900+ -110） = 10>0，为正值，表明不吸附。
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36楼2015-01-22 17:04:29
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月只蓝

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35楼: Originally posted by fentuo1203 at 2015-01-22 16:35:05
版主，还有一点就是，您说不做表面优化直接做吸附，但是，计算吸附能的话需要表面的总能量吧，难道说直接对表面计算能量吗。...

优化和能量计算两者可以分开进行。
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37楼2015-01-22 17:05:43
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月只蓝

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38楼: Originally posted by fentuo1203 at 2015-01-23 12:44:58
版主，还有一个问题就是，我要对各个晶面的吸附能进行比较，那每个晶面所含的NiCl2个数是不是要一致呢，不然的话所算出来的能量岂不是没有可比性。...

嗯，可以这样做。
其实随着晶面的增大，吸附能会收敛在一个稳定的数值。
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39楼2015-01-23 13:47:15
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