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fentuo1203

新虫 (初入文坛)

[交流] MS吸附能计算的问题

各位大神,本人用MS的CASTEP模块做吸附能计算,大概过程是:
1、根据FINDIT的数据构建的晶胞模型,没有做结构优化,因为优化后的参数跟实验值相差太大,所以没做优化
2、切面,选取的是(003)面,没有建立超晶胞,第一层和最低层原子是一样的。随后对该Slab进行了结构优化。计算了单点能。
3、计算了被吸附小分子的能量,直接建立分子结构优化后进行的单点能计算。
4、将优化后的小分子加到第二步优化后的Slab上,固定下面一半,上面一半弛豫。
定义吸附能=系统能量-之前单个的能量,根据这个计算得到的吸附能是正值,相当于该反应是吸热反应,这应该是不可能的。
备注:我计算的是NiCl2晶体表面的吸附。

请各位大神不吝赐教,本人感激不尽!
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李大哥110

新虫 (小有名气)


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引用回帖:
31楼: Originally posted by 月只蓝 at 2015-01-21 11:16:36
按理说不选择 优化cell,晶格常数不会变的。
如果这个问题解决不了,表面优化这一步就不要做了吧,做下面的吸附看看。...

大神您好,我也是做吸附的。我现在是研究几种溶剂在硫酸钡和硫酸锶的晶体表面的物理吸附和化学吸附作用,用第一性原理和分子动力学解释这几种溶剂对硫酸钡和硫酸锶晶体的晶面生长的影响。现在遇到的问题是,我看了类似文献里用forcite和morphology这两个模块里面的力场,其中博士论文里用compass算的。然而钡和锶并不在compass的力场参数文件包含的元素里,是自己编译力场文件么。硕士论文里用的 universal这个力场。但我感觉universal力场的话是不是相比compass力场准确性差不少。但compass力场也没有钡和锶单独的力场参数文件。请问这种情况,怎么处理呢。谢谢您。
43楼2021-03-18 18:17:13
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DRP7

新虫 (小有名气)

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[ 发自iPhone7客户端 ]
2楼2015-01-11 23:44:24
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月只蓝

主管区长 (职业作家)

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fentuo1203: 金币+10 2015-01-12 10:41:18
第一步存在问题,模拟计算一个很关键的问题就是:你如何证明,你选用的计算参数设置是合理的?如果不能解决这个问题,后续的吸附能计算结果的准确性也会受质疑。
一般说来,为了保证计算的可信,会采用做几何优化时的参数设置来做后续的计算。所以建议,几何优化这一步时调整计算参数(实际上这一块要做的工作很多,比如交换能相关函数、赝势、E-cutoff、k-points等参数的设置,这些都是CASTEP计算的最基础步骤),使得计算值和实验值相差<2%。
MATLAB、MS小问题、普通问题请发帖求助!时间精力有限,恕不接受无偿私信求助。
3楼2015-01-12 08:59:00
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fentuo1203

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 月只蓝 at 2015-01-12 08:59:00
第一步存在问题,模拟计算一个很关键的问题就是:你如何证明,你选用的计算参数设置是合理的?如果不能解决这个问题,后续的吸附能计算结果的准确性也会受质疑。
一般说来,为了保证计算的可信,会采用做几何优化时 ...

版主您好,非常感谢您的指点,我对这些参数的设置也进行了一些尝试,但是得到的结果都有一个倾向,就是能量值上下波动,没有规律,所以也不收敛,我想知道产生这样的现象有哪些特定的原因。感谢!下面是其中一个优化的能量变化图。http://image.keyan.cc/data/bcs/2 ... _1421038685_320.jpg
MS吸附能计算的问题
NiCl2 cell Energies.jpg

4楼2015-01-12 12:58:27
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