24小时热门版块排行榜    

查看: 10105  |  回复: 42
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

fentuo1203

新虫 (初入文坛)

[交流] MS吸附能计算的问题

各位大神,本人用MS的CASTEP模块做吸附能计算,大概过程是:
1、根据FINDIT的数据构建的晶胞模型,没有做结构优化,因为优化后的参数跟实验值相差太大,所以没做优化
2、切面,选取的是(003)面,没有建立超晶胞,第一层和最低层原子是一样的。随后对该Slab进行了结构优化。计算了单点能。
3、计算了被吸附小分子的能量,直接建立分子结构优化后进行的单点能计算。
4、将优化后的小分子加到第二步优化后的Slab上,固定下面一半,上面一半弛豫。
定义吸附能=系统能量-之前单个的能量,根据这个计算得到的吸附能是正值,相当于该反应是吸热反应,这应该是不可能的。
备注:我计算的是NiCl2晶体表面的吸附。

请各位大神不吝赐教,本人感激不尽!
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

RicKillMercy

木虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
像一封公开的来往信件,看完了,真好。
41楼2017-04-05 10:46:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 43 个回答

DRP7

新虫 (小有名气)

围观

[ 发自iPhone7客户端 ]
2楼2015-01-11 23:44:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

月只蓝

主管区长 (职业作家)

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
fentuo1203: 金币+10 2015-01-12 10:41:18
第一步存在问题,模拟计算一个很关键的问题就是:你如何证明,你选用的计算参数设置是合理的?如果不能解决这个问题,后续的吸附能计算结果的准确性也会受质疑。
一般说来,为了保证计算的可信,会采用做几何优化时的参数设置来做后续的计算。所以建议,几何优化这一步时调整计算参数(实际上这一块要做的工作很多,比如交换能相关函数、赝势、E-cutoff、k-points等参数的设置,这些都是CASTEP计算的最基础步骤),使得计算值和实验值相差<2%。
MATLAB、MS小问题、普通问题请发帖求助!时间精力有限,恕不接受无偿私信求助。
3楼2015-01-12 08:59:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fentuo1203

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 月只蓝 at 2015-01-12 08:59:00
第一步存在问题,模拟计算一个很关键的问题就是:你如何证明,你选用的计算参数设置是合理的?如果不能解决这个问题,后续的吸附能计算结果的准确性也会受质疑。
一般说来,为了保证计算的可信,会采用做几何优化时 ...

版主您好,非常感谢您的指点,我对这些参数的设置也进行了一些尝试,但是得到的结果都有一个倾向,就是能量值上下波动,没有规律,所以也不收敛,我想知道产生这样的现象有哪些特定的原因。感谢!下面是其中一个优化的能量变化图。http://image.keyan.cc/data/bcs/2 ... _1421038685_320.jpg
MS吸附能计算的问题
NiCl2 cell Energies.jpg

4楼2015-01-12 12:58:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 感觉是下周放榜了 +4 angus9576 2026-08-17 8/400 2026-08-17 17:26 by angus9576
[基金申请] filecode=后面第一个是大写字母 +8 wangze12014 2026-08-14 10/500 2026-08-17 17:05 by xter9665
[基金申请] 欢迎发来filecode的Mz6后的代码验证其规律 +34 医学老男孩 2026-08-13 81/4050 2026-08-17 16:20 by yudaoqian88
[基金申请] 时间戳变了,能看出什么问题? +4 基诺咪客 2026-08-17 4/200 2026-08-17 16:10 by Vivilian
[基金申请] 哪位老哥知道今年的国自然具体哪一天放榜? +12 Ldrop2023 2026-08-13 15/750 2026-08-17 15:02 by 小豌豆_发芽
[基金申请] 今天系统多次维护,明天很可能放榜! +8 zju2000 2026-08-16 9/450 2026-08-17 12:20 by lmz0216
[基金申请] 时间戳又变了8-15 +13 archvillain 2026-08-15 25/1250 2026-08-16 20:13 by zhaosm1982
[基金申请] 2027广东省杰青 +3 奶牛小黑 2026-08-15 6/300 2026-08-16 20:07 by 奶牛小黑
[基金申请] 快农历七夕节了,轻松一下,男人悄悄话,女施主请不要进来。 +3 Tide man 2026-08-14 3/150 2026-08-16 17:47 by jurkat.1640
[基金申请] 咱们一起用铁证分析2026国家社科基金中标与否 +7 启萌科技 2026-08-12 26/1300 2026-08-16 12:35 by 启萌科技
[基金申请] 有时候,自然基金真的不能太认真 (我的申报经验) +10 majunge000 2026-08-11 12/600 2026-08-16 08:18 by xli1984
[基金申请] 各位道友,我要去昆明玩几天,回来见。 +7 Tide man 2026-08-14 8/400 2026-08-15 01:11 by arzu_hma
[硕博家园] 读博的好处 +4 lnee 2026-08-11 4/200 2026-08-14 10:20 by ahsoarli
[基金申请] 重要来源:本周末出结果 +10 瞬息宇宙 2026-08-12 10/500 2026-08-13 15:46 by likettle
[基金申请] 不应该看fileCode +7 且听虎啸 2026-08-12 9/450 2026-08-13 14:27 by flydreamws
[基金申请] Filecode 又变了,巨变 +3 WH3796 2026-08-12 4/200 2026-08-13 14:13 by 小木虫6752397
[基金申请] 分享一下我之前已中青C的计划书的filecode +4 布布和一二 2026-08-11 5/250 2026-08-13 12:56 by cratir
[基金申请] 结合人工智能,周易传统文化,filecode打分制来了,3分以上希望很大。 +3 Tide man 2026-08-12 4/200 2026-08-13 08:35 by ZJTJZ
[基金申请] 2019年青年基金涵评意见,大家看看几个A,几个B? +11 Tide man 2026-08-11 11/550 2026-08-13 07:35 by 撸猫猫
[基金申请] 什么时候出结果,有咨询渠道??? +3 Tide man 2026-08-11 3/150 2026-08-11 17:54 by kudofaye
信息提示
请填处理意见