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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 分类/鉴定 » 丝状真菌紫外诱变是否可能改变其种属？
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jkluwang1

铁虫 (初入文坛)

[求助] 丝状真菌紫外诱变是否可能改变其种属？

实验室在做真菌紫外诱变育种过程中分离到一株菌落形态与初始菌株相差较大的菌株，经DNA鉴定，确定与初始菌株不同属。查了文献，没看到相关的报道，有没有其他同仁在做此类实验时出现类似情况的，或者知道原因的，求解答，多谢！（非杂菌污染，后续诱变过程中也出现类似菌株）
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Nothingisimpossible
1楼 2015-01-09 17:03:47
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松松一号

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
我们也做过紫外诱变，不能说是改变种属的，只是你用来鉴定的那一段核苷酸发生了突变。
你们DNA鉴定用的哪一段序列，建议多选几段，看看突变的程度。
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2楼2015-01-09 21:45:37
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jkluwang1

铁虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 松松一号 at 2015-01-09 21:45:37
我们也做过紫外诱变，不能说是改变种属的，只是你用来鉴定的那一段核苷酸发生了突变。
你们DNA鉴定用的哪一段序列，建议多选几段，看看突变的程度。

一般都是提出来基因组，然后送基因公司测序，保守序列18srDNA。
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Nothingisimpossible
3楼2015-01-09 21:58:37
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microbhbu

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
紫外诱变后的突变株形态变化也正常，18s保守序列应该不会变化多少。诱变不会对菌株引起分类地位的变化，这是肯定的。楼主的序列是全序列吗？是不是有可变区有细微差别啊？总之绝对不会改变种属，绝对到不了那种程度！否则，诱变一次出一新种，那得多少SCI啊！呵呵

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4楼2015-01-09 23:17:27
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松松一号

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by jkluwang1 at 2015-01-09 21:58:37
一般都是提出来基因组，然后送基因公司测序，保守序列18srDNA。...

嗯，通用的鉴定方法，18s 只是一小段保守序列，不是新种的标志，形成一个新种的条件很多，需要多代，从进化的角度产生了生殖隔离才能叫新物种。诱变后的形态变化，可以说是新的菌株，突变株。
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5楼2015-01-10 09:35:58
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jkluwang1

铁虫 (初入文坛)
引用回帖:
4楼: Originally posted by microbhbu at 2015-01-09 23:17:27
紫外诱变后的突变株形态变化也正常，18s保守序列应该不会变化多少。诱变不会对菌株引起分类地位的变化，这是肯定的。楼主的序列是全序列吗？是不是有可变区有细微差别啊？总之绝对不会改变种属，绝对到不了那种程度 ...

是啊，我也感觉挺奇怪的，但是一般菌种鉴定都用的18sDNA,即使种的变化可以理解，那么，现在连属都变化了，相关文献也没有介绍出现这种情况的。这个初始真菌我们还未测过全基因组，太贵，没法测。
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Nothingisimpossible
6楼2015-01-11 23:37:57
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jkluwang1

铁虫 (初入文坛)
引用回帖:
5楼: Originally posted by 松松一号 at 2015-01-10 09:35:58
嗯，通用的鉴定方法，18s 只是一小段保守序列，不是新种的标志，形成一个新种的条件很多，需要多代，从进化的角度产生了生殖隔离才能叫新物种。诱变后的形态变化，可以说是新的菌株，突变株。...

恩，是啊。一般来说，这个保守序列是最保守的，一般的紫外诱变不可能破坏这段序列。而且诱变出来的突变株也存在，不是不存在的。
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Nothingisimpossible
7楼2015-01-11 23:48:16
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jkluwang1

铁虫 (初入文坛)
引用回帖:
5楼: Originally posted by 松松一号 at 2015-01-10 09:35:58
嗯，通用的鉴定方法，18s 只是一小段保守序列，不是新种的标志，形成一个新种的条件很多，需要多代，从进化的角度产生了生殖隔离才能叫新物种。诱变后的形态变化，可以说是新的菌株，突变株。...

您晓得不晓得菌种诱变方面的大牛，不行的话，向他们请教一下。
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Nothingisimpossible
8楼2015-01-11 23:50:02
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microbhbu

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

引用回帖:
6楼: Originally posted by jkluwang1 at 2015-01-11 23:37:57
是啊，我也感觉挺奇怪的，但是一般菌种鉴定都用的18sDNA,即使种的变化可以理解，那么，现在连属都变化了，相关文献也没有介绍出现这种情况的。这个初始真菌我们还未测过全基因组，太贵，没法测。...

丝状真菌是不是仅靠18S就可以定种属？我觉得不一定找诱变研究的大牛，找个系统分类方面的大牛咨询一下倒是真的。可惜我们这里都是做原核，真菌还真不好说

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9楼2015-01-12 06:24:36
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松松一号

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
8楼: Originally posted by jkluwang1 at 2015-01-11 23:50:02
您晓得不晓得菌种诱变方面的大牛，不行的话，向他们请教一下。...

那可能是测序不太准，18S变有可能，你选其他几段保守序列如ITS 序列再试试。
另外不要送PCR产物测序，连接转化之后送菌液测序更准。
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10楼2015-01-12 09:56:18
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