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dashuai1133

新虫 (小有名气)

[求助] phonopy生成声子谱的PRIMITIVE_AXIS和PRIMITIVE_AXIS设置 已有1人参与

用phonopy将所有的vasprun.xml结果汇总得到力常数矩阵已做完,生成FORCE_SETS,看手册上说运行phonopy -f band.conf就能出结果。但对于band.conf的具体参数不太理解,不会设置。请各位老师指点:PRIMITIVE_AXIS=?
PRIMITIVE_AXIS=?
在线等结果。
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匿名

用户注销 (职业作家)

本帖仅楼主可见
18楼2016-03-21 20:25:25
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fyuewen

金虫 (正式写手)

原题引用“用phonopy将所有的vasprun.xml结果汇总得到力常数矩阵已做完,生成FORCE_SETS,看手册上说运行phonopy -f band.conf就能出结果。但对于band.conf的具体参数不太理解,不会设置。请各位老师指点:PRIMITIVE_AXIS=?
PRIMITIVE_AXIS=?”

PRIMITIVE_AXIS的定义,其实在官网上的settings中已经给出(虽然有一处作者有点笔误)。而且楼上有一位其实已经说的很清楚了。M_p是用来对unit cell转化成 primitive cell用的。
具体定义为(a_p, b_p, c_p) = (a_u, b_u, c_u)*M_p  此处p代表primitive cell, u 代表unit cell.
Physicsloveukulele!Aloha!
21楼2016-06-09 16:46:09
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普通回帖

dashuai1133

新虫 (小有名气)

希望有老师能给指导指导
2楼2014-12-24 15:16:45
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dashuai1133

新虫 (小有名气)

看phonopy的example中,感觉BAND的设置和castep里BZ path是一样的,不知道理解的对不对?
3楼2014-12-24 16:19:27
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dx0620

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
ljw4010: 金币+2, 谢谢交流! 2014-12-25 20:02:09
你可以把这一行去掉,因为一般你计算的时候是不会选取原胞的,这个是原胞基矢的选项,所以不用加这一个参量。band.conf可以这样写:
ATOM_NAME=
DIM = 2 2 2
BAND = 0 0 0 0 0 0.5 -0.5 0 0.5 -0.5 0 0 -0.5 0.5 0 0 0.5 0 0 0.5 0.5 -0.5 0.5 0.5
BAND_POINTS = 101
BAND_LABELS = \Gamma Z T Y S X U R

BAND确实可以选取跟castep一样的,或者自己选点也行
4楼2014-12-25 09:21:31
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匿名

用户注销 (职业作家)


ljw4010: 金币+1, 应助指数+1, 谢谢交流! 2014-12-25 20:02:40
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5楼2014-12-25 15:39:18
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黄河honour

铁杆木虫 (正式写手)

学习

[ 发自小木虫客户端 ]
不管身处哪一方土地记得在那儿树一杆大旗上面写上“艰苦奋斗”四个大字!
6楼2014-12-25 16:38:15
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gaoenlai110

银虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by dx0620 at 2014-12-25 09:21:31
你可以把这一行去掉,因为一般你计算的时候是不会选取原胞的,这个是原胞基矢的选项,所以不用加这一个参量。band.conf可以这样写:
ATOM_NAME=
DIM = 2 2 2
BAND = 0 0 0 0 0 0.5 -0.5 0 0.5 -0.5 0 0 -0.5 0. ...

在phonopy里不设置PRIMITIVE_AXIS不行吧,测试一个例子NaCl,如果把这行注释掉,画的图完全不一样啊!
7楼2015-03-13 17:08:29
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我爱天津

金虫 (正式写手)

没有相关理论知识的我 完全不知道这个PRIMITIVE_AXIS怎么设置啊
8楼2015-03-19 17:15:33
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sissiya

银虫 (小有名气)

引用回帖:
8楼: Originally posted by 我爱天津 at 2015-03-19 17:15:33
没有相关理论知识的我 完全不知道这个PRIMITIVE_AXIS怎么设置啊

你现在搞明白这个该怎么设了么?我也是一直不懂
9楼2015-11-04 10:13:10
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我爱天津

金虫 (正式写手)

引用回帖:
9楼: Originally posted by sissiya at 2015-11-04 10:13:10
你现在搞明白这个该怎么设了么?我也是一直不懂...

明白了 妹纸 加我扣扣讨论

发自小木虫Android客户端
10楼2015-11-04 10:41:55
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