24小时热门版块排行榜    

查看: 4054  |  回复: 21

dashuai1133

新虫 (小有名气)

[求助] phonopy生成声子谱的PRIMITIVE_AXIS和PRIMITIVE_AXIS设置 已有1人参与

用phonopy将所有的vasprun.xml结果汇总得到力常数矩阵已做完,生成FORCE_SETS,看手册上说运行phonopy -f band.conf就能出结果。但对于band.conf的具体参数不太理解,不会设置。请各位老师指点:PRIMITIVE_AXIS=?
PRIMITIVE_AXIS=?
在线等结果。
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

匿名

用户注销 (职业作家)

本帖仅楼主可见
18楼2016-03-21 20:25:25
已阅   申请1ST强帖   回复此楼   编辑   查看我的主页

fyuewen

金虫 (正式写手)

原题引用“用phonopy将所有的vasprun.xml结果汇总得到力常数矩阵已做完,生成FORCE_SETS,看手册上说运行phonopy -f band.conf就能出结果。但对于band.conf的具体参数不太理解,不会设置。请各位老师指点:PRIMITIVE_AXIS=?
PRIMITIVE_AXIS=?”

PRIMITIVE_AXIS的定义,其实在官网上的settings中已经给出(虽然有一处作者有点笔误)。而且楼上有一位其实已经说的很清楚了。M_p是用来对unit cell转化成 primitive cell用的。
具体定义为(a_p, b_p, c_p) = (a_u, b_u, c_u)*M_p  此处p代表primitive cell, u 代表unit cell.
Physicsloveukulele!Aloha!
21楼2016-06-09 16:46:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

dashuai1133

新虫 (小有名气)

希望有老师能给指导指导
2楼2014-12-24 15:16:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dashuai1133

新虫 (小有名气)

看phonopy的example中,感觉BAND的设置和castep里BZ path是一样的,不知道理解的对不对?
3楼2014-12-24 16:19:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dx0620

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
ljw4010: 金币+2, 谢谢交流! 2014-12-25 20:02:09
你可以把这一行去掉,因为一般你计算的时候是不会选取原胞的,这个是原胞基矢的选项,所以不用加这一个参量。band.conf可以这样写:
ATOM_NAME=
DIM = 2 2 2
BAND = 0 0 0 0 0 0.5 -0.5 0 0.5 -0.5 0 0 -0.5 0.5 0 0 0.5 0 0 0.5 0.5 -0.5 0.5 0.5
BAND_POINTS = 101
BAND_LABELS = \Gamma Z T Y S X U R

BAND确实可以选取跟castep一样的,或者自己选点也行
4楼2014-12-25 09:21:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

匿名

用户注销 (职业作家)


ljw4010: 金币+1, 应助指数+1, 谢谢交流! 2014-12-25 20:02:40
本帖仅楼主可见
5楼2014-12-25 15:39:18
已阅   申请1ST强帖   回复此楼   编辑   查看我的主页

黄河honour

铁杆木虫 (正式写手)

学习

[ 发自小木虫客户端 ]
不管身处哪一方土地记得在那儿树一杆大旗上面写上“艰苦奋斗”四个大字!
6楼2014-12-25 16:38:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gaoenlai110

银虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by dx0620 at 2014-12-25 09:21:31
你可以把这一行去掉,因为一般你计算的时候是不会选取原胞的,这个是原胞基矢的选项,所以不用加这一个参量。band.conf可以这样写:
ATOM_NAME=
DIM = 2 2 2
BAND = 0 0 0 0 0 0.5 -0.5 0 0.5 -0.5 0 0 -0.5 0. ...

在phonopy里不设置PRIMITIVE_AXIS不行吧,测试一个例子NaCl,如果把这行注释掉,画的图完全不一样啊!
7楼2015-03-13 17:08:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

我爱天津

金虫 (正式写手)

没有相关理论知识的我 完全不知道这个PRIMITIVE_AXIS怎么设置啊
8楼2015-03-19 17:15:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sissiya

银虫 (小有名气)

引用回帖:
8楼: Originally posted by 我爱天津 at 2015-03-19 17:15:33
没有相关理论知识的我 完全不知道这个PRIMITIVE_AXIS怎么设置啊

你现在搞明白这个该怎么设了么?我也是一直不懂
9楼2015-11-04 10:13:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

我爱天津

金虫 (正式写手)

引用回帖:
9楼: Originally posted by sissiya at 2015-11-04 10:13:10
你现在搞明白这个该怎么设了么?我也是一直不懂...

明白了 妹纸 加我扣扣讨论

发自小木虫Android客户端
10楼2015-11-04 10:41:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 dashuai1133 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[硕博家园] 请教兼职经验 +3 是阿文鸭 2026-08-09 3/150 2026-08-14 12:07 by HER12025
[基金申请] 小木虫上这么多卖论文的,真有人买论文么?感觉没必要啊 +10 Tide man 2026-08-10 11/550 2026-08-14 10:30 by 沁言学术
[硕博家园] 读博的好处 +4 lnee 2026-08-11 4/200 2026-08-14 10:20 by ahsoarli
[基金申请] FileCode能看出啥? +10 要乐观耀哥 2026-08-10 32/1600 2026-08-14 09:37 by 要乐观耀哥
[基金申请] 我的国基提前知道中了,可是同事的操作让我实在接受不了,怎么会有这样的人 +10 家与远方 2026-08-10 15/750 2026-08-14 02:08 by 绵羊哥哥
[基金申请] 关于Filecode分析方法 +9 majunge000 2026-08-10 12/600 2026-08-13 23:20 by iwuli
[基金申请] 静等基金结果 +8 gjjjzhong 2026-08-10 21/1050 2026-08-13 17:56 by 且听虎啸
[基金申请] 重要来源:本周末出结果 +10 瞬息宇宙 2026-08-12 10/500 2026-08-13 15:46 by likettle
[基金申请] Filecode 又变了,巨变 +3 WH3796 2026-08-12 4/200 2026-08-13 14:13 by 小木虫6752397
[基金申请] 分享一下我之前已中青C的计划书的filecode +4 布布和一二 2026-08-11 5/250 2026-08-13 12:56 by cratir
[基金申请] 结合人工智能,周易传统文化,filecode打分制来了,3分以上希望很大。 +3 Tide man 2026-08-12 4/200 2026-08-13 08:35 by ZJTJZ
[基金申请] 综述论文作为代表作会不会影响评审专家的印象分? +11 yufeiwaner 2026-08-09 13/650 2026-08-12 08:17 by yufeiwaner
[基金申请] 帮忙看看fileCode +7 wwncly 2026-08-10 13/650 2026-08-11 19:36 by 冰心玉壶晴
[基金申请] 什么时候出结果,有咨询渠道??? +3 Tide man 2026-08-11 3/150 2026-08-11 17:54 by kudofaye
[基金申请] 据悉今年马上要出结果了 +7 瞬息宇宙 2026-08-10 8/400 2026-08-10 12:42 by Vivilian
[基金申请] 这样的filecode谁见过 +11 布布和一二 2026-08-08 22/1100 2026-08-10 11:10 by wmfsnow
[基金申请] 面上项目filecode邪修 +5 西山十月 2026-08-09 7/350 2026-08-10 07:32 by 仁砚薪传
[基金申请] fileCode有新解读? +10 Tide man 2026-08-08 18/900 2026-08-09 12:55 by 仁砚薪传
[基金申请] 国基金的申报应该改成非等额制,评价高的钱多评价低的钱少,但是增加资助率 +7 a089 2026-08-07 7/350 2026-08-08 18:05 by gltch
[基金申请] 关于filecode +4 布布和一二 2026-08-07 7/350 2026-08-07 22:55 by zhanghaozhu
信息提示
请填处理意见