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snowgary木虫 (正式写手)
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[交流]
【讨论】分子动力学模拟高分子构象的讨论。
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大家好，我本人并非做高分子构象方面的，但在不经意的时候发现个问题，不知道大家有没有遇到过，我对一个长链高分子做分子动力学模拟的时候（单个分子能量最优化后几何优化，或者放到一个盒子中去能量最优化然后跑动力学），其最终的构象与你开始建模时候的构象关系很大，如果我自动生成高分子，一般都是直链的，能量最优化或者几何优化后，其构象几乎没什么太大变化，如果我用手自己画一个很弯曲的相等长度的高分子，几何优化后其构象也变化不大，但两种建模方法的构象确截然不同，请问大家这种情况该怎么处理呢？我突然对分子动力学产生一点怀疑了。。。 本人为初学者，有说的不专业的地方还请大家谅解。 谢谢了。 |
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snowgary
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