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hunterbleach

新虫 (初入文坛)

[求助] ms cestep优化问题

各位老师,我想建一个有机物在水溶液中吸附到金属表面的模型,我打算这样(刚入门四天,错误叠出,有些地方不知道怎么描述,直接用软件中的词来描述)
1.建金属的晶胞,优化,再能量最小化
2建有机分子,优化,能量最小化后粘贴到金属表面真空
3建水盒子
4build layer到金属表面
整个过程对吗?还有就是我在有机分子优化时,出了问题,教程中是用co吸附到pt表面为例,在晶胞内直接add atoms,但是我这个有机物太复杂了,我是自己在ms中画出来,重拍后,直接粘贴移动到一个晶胞里的,这样可行吗?在准备CESTEP 优化时,发现一只优化不了,是因为分子太复杂了吗?就是一个82原子的有机物而已啊。

我之前的过程是把水和有机物放到一个盒子里,再弛豫,build layer到金属表面,跑完后发现有机物还是在水中,并未跑到金属表面去啊。
希望能得到各位老师指导吧
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