24小时热门版块排行榜    

查看: 4954  |  回复: 21
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

xxxxxxxfc

金虫 (正式写手)

[求助] ts confirmation如何使用

刚接触过渡态搜索,想知道一下,ts search后,如何确定虚频。是不是对ts search后生成的过渡态文件xsd,进行IR计算,再用震动分析。还是在TS search的时候就在属性里面勾选IR计算。还有计算声子可以实现不?在castep里面没有发现过渡态精修,即使发现虚频不止一个,要怎么应对呢?还有就是ts confirmation怎么使用,是对TS search计算生成的xtd文件进行计算吗?
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur

引用回帖:
13楼: Originally posted by xxxxxxxfc at 2015-01-02 11:36:16
对了,还想请教一个问题。因为castep里面没有频率计算,所以要进行振动分析(看虚频),需要计算声子谱,但是计算声子谱需要对原来得到的过渡态进行结构优化,这会改变过渡态的结构,岂不是没有意义了?还有就是虚频 ...

声子谱如果是通过有限差分的方法一般是对每个原子在平衡位+delta和-delta的能量做二阶差分,只是计算的时候挪动坐标,结果的反馈不包含这个挪动。一般周期体系那三个很小的虚频应该很容易区分,一般比50小得多。总之,castep做过渡态搜索还是相当麻烦,有条件(软硬件)的话不如去学vasp。
不一定挂在论坛,计算问题问题欢迎留言。
14楼2015-01-02 13:39:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 22 个回答

xxxxxxxfc

金虫 (正式写手)

求高人指点!!!!!!!!!!!1
2楼2014-12-19 08:57:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xxxxxxxfc

金虫 (正式写手)

咱们这个区做过渡态的应该不少吧,求知道的能细心指点一下!!!!!!!!
3楼2014-12-19 14:58:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur

★ ★
ljw4010: 金币+2, 谢谢交流! 2014-12-19 18:42:39
TS confirmation是在TS search的xtd上做,计算频率直接计算声子谱即可,一般超软赝势只能采用有限差分。如果有虚频要沿着虚频振动方向进行手工微调(印象是将虚频处键长*1.3,记得不清楚,可去量化版看看手工消虚频的方法),到目前手头上的7.0没法进行过渡态精修,下一个版本暂时不明。
不一定挂在论坛,计算问题问题欢迎留言。
4楼2014-12-19 17:49:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 国自然评审意见 +11 wangmingqi 2026-08-28 16/800 2026-08-29 08:05 by wangmingqi
[硕博家园] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 6/300 2026-08-29 07:59 by gy1nBQXYQJqL
[基金申请] 投票:  有多少人是今天查系统知道结果的? +16 爱看书的可乐 2026-08-26 18/900 2026-08-29 07:32 by winsaint
[基金申请] 为什么资助数各大高校都创新高,自己申请怎么就这么难 +12 Kittylucky 2026-08-27 13/650 2026-08-29 00:04 by superceng
[基金申请] 国自然面上复盘~欢迎讨论 (金币+15) +13 晴天加油 2026-08-26 14/700 2026-08-28 18:36 by huagongfeihu
[基金申请] 系统查不到 +11 董八千 2026-08-26 11/550 2026-08-28 18:06 by Leogzhya
[基金申请] 有没有仍没收到信息的 +3 德尚中行 2026-08-27 3/150 2026-08-28 15:24 by rongshuxia
[教师之家] 导师吐槽:我怎么摊上了这么个极品研究生! +8 苏东坡二世 2026-08-23 8/400 2026-08-28 14:41 by lkforward
[基金申请] 基金系统什么内容也没有 30+4 winsaint 2026-08-27 9/450 2026-08-28 11:06 by maolC
[基金申请] 怎么查啊 +6 huang1991js 2026-08-26 6/300 2026-08-28 08:42 by winsaint
[基金申请] 面上合作单位盖章 +5 ssyjh 2026-08-27 5/250 2026-08-27 20:50 by gdfollow
[基金申请] 看板上这么多中的,有点像50人群里49个人都是骗子的那种感觉…… +5 a089 2026-08-26 6/300 2026-08-27 14:05 by jonewore
[文学芳草园] 梦想 +3 myrtle 2026-08-26 3/150 2026-08-27 10:01 by angelyueyi
[基金申请] 我不理解! +15 Edward_pc 2026-08-26 23/1150 2026-08-26 20:34 by zzuzxg
[基金申请] 国际合作可查了,中了面上 (EPI+1)(金币+50) +18 Ldrop2023 2026-08-26 18/900 2026-08-26 11:15 by cmrandy
[基金申请] 系统进不去 +4 yanglien 2026-08-26 5/250 2026-08-26 11:10 by wenfengw83
[基金申请] 项目信息和经费信息在系统里都可以看到了 +6 wittyboy 2026-08-26 14/700 2026-08-26 10:55 by wittyboy
[基金申请] 国合可查了 +3 paperzjh 2026-08-26 3/150 2026-08-26 10:41 by LemmonTr
[基金申请] 如果此刻你正在为国基感到焦虑,不妨来听听这首《基金之外》 +8 scalable 2026-08-24 8/400 2026-08-25 12:52 by jnhyjjm
[基金申请] 没有任何消息-是不是就凉了 +9 图啦图啦 2026-08-24 10/500 2026-08-25 11:59 by 南海小哥
信息提示
请填处理意见