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xxxxxxxfc

金虫 (正式写手)

[求助] ts confirmation如何使用

刚接触过渡态搜索,想知道一下,ts search后,如何确定虚频。是不是对ts search后生成的过渡态文件xsd,进行IR计算,再用震动分析。还是在TS search的时候就在属性里面勾选IR计算。还有计算声子可以实现不?在castep里面没有发现过渡态精修,即使发现虚频不止一个,要怎么应对呢?还有就是ts confirmation怎么使用,是对TS search计算生成的xtd文件进行计算吗?
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卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur

引用回帖:
13楼: Originally posted by xxxxxxxfc at 2015-01-02 11:36:16
对了,还想请教一个问题。因为castep里面没有频率计算,所以要进行振动分析(看虚频),需要计算声子谱,但是计算声子谱需要对原来得到的过渡态进行结构优化,这会改变过渡态的结构,岂不是没有意义了?还有就是虚频 ...

声子谱如果是通过有限差分的方法一般是对每个原子在平衡位+delta和-delta的能量做二阶差分,只是计算的时候挪动坐标,结果的反馈不包含这个挪动。一般周期体系那三个很小的虚频应该很容易区分,一般比50小得多。总之,castep做过渡态搜索还是相当麻烦,有条件(软硬件)的话不如去学vasp。
不一定挂在论坛,计算问题问题欢迎留言。
14楼2015-01-02 13:39:21
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xxxxxxxfc

金虫 (正式写手)

求高人指点!!!!!!!!!!!1
2楼2014-12-19 08:57:09
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xxxxxxxfc

金虫 (正式写手)

咱们这个区做过渡态的应该不少吧,求知道的能细心指点一下!!!!!!!!
3楼2014-12-19 14:58:19
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卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur

★ ★
ljw4010: 金币+2, 谢谢交流! 2014-12-19 18:42:39
TS confirmation是在TS search的xtd上做,计算频率直接计算声子谱即可,一般超软赝势只能采用有限差分。如果有虚频要沿着虚频振动方向进行手工微调(印象是将虚频处键长*1.3,记得不清楚,可去量化版看看手工消虚频的方法),到目前手头上的7.0没法进行过渡态精修,下一个版本暂时不明。
不一定挂在论坛,计算问题问题欢迎留言。
4楼2014-12-19 17:49:28
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