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想飞的fish

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[交流] 动植物Optical mapping研究应用(一)

Optical Mapping技术是基于限制性内切酶图谱的技术,可以称之为光学化或数字化酶切指纹图谱技术。将DNA固定在界面上,在界面表面进行酶切反应,然后将DNA进行荧光染色,并在显微镜下观测。每条DNA被酶切后的片段大小及顺序形成单分子限制性酶切指纹。软件利用酶切指纹组装成最终的指纹图谱。

应用方向—辅助序列组装
辅助延伸scaffold,使基因组图谱更精细;
发现染色体的倒置、插入、缺失和置换;
识别并纠正错误组装序列;
检测gap大小及位置;
技术流程

DNA样品制备


未完待续
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