24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 1282  |  回复: 5

羽翼之南

新虫 (初入文坛)

[求助] 求助:VMD建模蛋白三聚体之间出现一些原来没有的键 已有1人参与

一个蛋白质三聚体的PDB文件使用vmd生成psf文件后,出现一堆原来没有的链。新手,求大神帮助!~~如附件图,近乎直线的那些链只打开pdb是没有的。。。

求助:VMD建模蛋白三聚体之间出现一些原来没有的键
snap_看图王.png
回复此楼

» 猜你喜欢

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gn02530640

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
用文本编辑器打开pdb文件,最下面是否有 CONECT 的信息? 有的话全部删掉,存档后再用 VMD 打开来看看
2楼2014-12-13 21:28:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gn02530640

银虫 (小有名气)

忘了说,建议另存成新的文件(也就是保留原pdb文件)

还是不行的话把pdb文件上传吧,我假日有空找时间来试试
3楼2014-12-13 21:32:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

羽翼之南

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by gn02530640 at 2014-12-13 21:32:34
忘了说,建议另存成新的文件(也就是保留原pdb文件)

还是不行的话把pdb文件上传吧,我假日有空找时间来试试

附件是pdb,刚刚找了好像没有那部分。。

» 本帖附件资源列表

  • 欢迎监督和反馈:小木虫仅提供交流平台,不对该内容负责。
    本内容由用户自主发布,如果其内容涉及到知识产权问题,其责任在于用户本人,如对版权有异议,请联系邮箱:xiaomuchong@tal.com
  • 附件 1 : mine.pdb
  • 2014-12-14 18:16:05, 285.82 K
4楼2014-12-14 18:16:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

羽翼之南

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by gn02530640 at 2014-12-13 21:32:34
忘了说,建议另存成新的文件(也就是保留原pdb文件)

还是不行的话把pdb文件上传吧,我假日有空找时间来试试

多谢大神!!!!拜托拜托
5楼2014-12-14 18:25:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gn02530640

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

??????????????????????????????????????????????

?????????????????457??л???????????ALA?л????????OXT????????????top_all27_prot_lipid_na.inp (??rtf???) ????????????????У???Щ???????????top?????????????????????????????????????psf?????????о?????????????????????????????top??????????е???鷳????????????top???????????????psf?????

???????????VMD??Modeling??Automatic PSF Builder ??????psf?????????????鲻??????????????????????????????????psf????????Щ??

??????
6楼2014-12-14 21:23:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 羽翼之南 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 317分 一志愿南理工材料工程 本科湖工大 求调剂 +6 芋泥小铃铛 2026-03-28 6/300 2026-03-28 14:15 by Ainin_
[考研] 0703本科郑州大学求调剂 +3 nhj_ 2026-03-25 3/150 2026-03-28 13:24 by Iveryant
[考研] 求调剂 +6 芦lty 2026-03-25 7/350 2026-03-28 13:13 by 唐沐儿
[考研] 286求调剂 +12 PolarBear11 2026-03-26 12/600 2026-03-28 12:14 by zllcz
[考研] 数一英一271专硕(085401)求调剂,可跨 +4 前行必有光 2026-03-28 5/250 2026-03-28 11:27 by xuxiang
[考研] 一志愿南京航空航天大学材料学硕求调剂 +3 @taotao 2026-03-28 3/150 2026-03-28 10:26 by JourneyLucky
[考研] 085405 考的11408求各位老师带走 +3 Qiu学ing 2026-03-28 3/150 2026-03-28 09:19 by 乐呵呵的追梦人
[考研] 279 分 求调剂 +4 睡个好觉_16 2026-03-24 4/200 2026-03-27 15:05 by 醉在风里
[论文投稿] Journal of Mechanical Science and Technology +3 Russ_ss 2026-03-25 5/250 2026-03-27 10:49 by 陆小果画大饼
[考研] 324求调剂 +8 hanamiko 2026-03-26 10/500 2026-03-27 08:06 by hypershenger
[考研] 081200-11408-276学硕求调剂 +3 崔wj 2026-03-26 3/150 2026-03-27 07:58 by chemisry
[考研] 总分322求生物学/生化与分子/生物信息学相关调剂 +5 星沉uu 2026-03-26 6/300 2026-03-26 19:02 by macy2011
[考研] 一志愿哈工大,085400,320,求调剂 +4 gdlf9999 2026-03-24 4/200 2026-03-25 23:01 by boxking200
[考研] 332求调剂 +6 032500 2026-03-25 6/300 2026-03-25 22:45 by 418490947
[考研] B区考研调剂 +4 yqdszhdap- 2026-03-22 5/250 2026-03-25 08:51 by baoball
[考研] 307求调剂 +3 余意卿 2026-03-21 6/300 2026-03-24 15:03 by 余意卿
[考研] 277分求调剂,跨调材料 +3 考研调剂lxh 2026-03-24 3/150 2026-03-24 13:52 by JourneyLucky
[考研] 315分,诚求调剂,材料与化工085600 +3 13756423260 2026-03-22 3/150 2026-03-22 20:11 by edmund7
[考研] 275求调剂 +6 shansx 2026-03-22 8/400 2026-03-22 15:27 by barlinike
[考研] 求调剂院校信息 +6 CX 330 2026-03-21 6/300 2026-03-22 15:25 by 无懈可击111
信息提示
请填处理意见