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gamma337

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[交流] 【求助】径向分布函数

在分子模拟中，我们计算体系的径向分布函数的时候，一般取dr为多少？

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1楼 2008-05-21 10:05:05

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shalene

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★ ★
lei0736(金币+1,VIP+0):谢谢
gamma337(金币+1,VIP+0):恩，

0.002-0.005nm

2楼2008-05-21 11:23:05

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gamma337

银虫 (小有名气)

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引用回帖:

Originally posted by shalene at 2008-5-21 11:23:
0.002-0.005nm

这样取有什么依据吗？
我请教过一个老师，他让我在所取的，比如是10个埃，分成一千份，然后进行统计。
按你的说法，分成200-500均份，也是很小的，一般的原子的半径都会大于1，我们取的时候难道不要把原子半径的因素考虑进去吗，分的这么小会不会造成统计结果在r上有很大的涨落？

[ Last edited by gamma337 on 2008-5-22 at 09:49 ]

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3楼2008-05-22 09:47:06

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lei0736

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★
gamma337(金币+1,VIP+0):恩，有道理

不用考虑原子半径在计算的时候不存在原子实际大小只是一个坐标而已
分多少份看你了分太细了曲线会有毛刺不光滑

4楼2008-05-22 12:20:08

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honghuzlj

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★
gamma337(金币+1,VIP+0):网上搜，有很多，其中DLpoly带有rdf的源程序

牛，能分享您的Fortran程序么？谢谢

5楼2008-05-22 23:08:55

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honghuzlj

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我们已经找到，谢谢

6楼2008-06-06 14:48:44

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magyi_she

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请问能分享您的源程序吗？

7楼2008-09-23 17:27:02

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xjping

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我觉得应该没有一定的标准吧！还要看你的体系和你需要的精度！

8楼2008-09-26 14:51:19

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ramond.wan

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能分享你的源程序吗

9楼2008-10-08 22:54:42

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chirs8406

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★ ★
zzgyb(金币+2,VIP+0):谢谢你的参与，欢迎再次光临计算模拟版！

gamma337(金币+1,VIP+0):网上搜，有很多，其中DLpoly带有rdf的源程序

但是DLpoly带有rdf的源程序只适合做球状半径的，我们一般都不用，只是自己编程序，而且，dr取值是按 lei0736说的，你自己掂量着让径向分布函数不要太尖锐，液不要太多毛刺

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10楼2008-10-29 21:19:35

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