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gamma337

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助】径向分布函数

在分子模拟中,我们计算体系的径向分布函数的时候,一般取dr为多少?
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chirs8406

木虫 (著名写手)

★ ★
zzgyb(金币+2,VIP+0):谢谢你的参与,欢迎再次光临计算模拟版!
gamma337(金币+1,VIP+0):网上搜,有很多,其中DLpoly带有rdf的源程序


但是DLpoly带有rdf的源程序只适合做球状半径的,我们一般都不用,只是自己编程序,而且,dr取值是按 lei0736说的,你自己掂量着让径向分布函数不要太尖锐,液不要太多毛刺
10楼2008-10-29 21:19:35
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gamma337

银虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by shalene at 2008-5-21 11:23:
0.002-0.005nm

这样取有什么依据吗?
我请教过一个老师,他让我在所取的,比如是10个埃,分成一千份,然后进行统计。
按你的说法,分成200-500均份,也是很小的,一般的原子的半径都会大于1,我们取的时候难道不要把原子半径的因素考虑进去吗,分的这么小会不会造成统计结果在r上有很大的涨落?

[ Last edited by gamma337 on 2008-5-22 at 09:49 ]
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3楼2008-05-22 09:47:06
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lei0736

荣誉版主 (职业作家)

优秀版主


gamma337(金币+1,VIP+0):恩,有道理
不用考虑原子半径 在计算的时候不存在原子实际大小 只是一个坐标而已
分多少份看你了 分太细了曲线会有毛刺 不光滑
4楼2008-05-22 12:20:08
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honghuzlj

木虫 (著名写手)


gamma337(金币+1,VIP+0):网上搜,有很多,其中DLpoly带有rdf的源程序
牛,能分享您的Fortran程序么?谢谢
5楼2008-05-22 23:08:55
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