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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » 【求助】径向分布函数
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gamma337

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助】径向分布函数

在分子模拟中，我们计算体系的径向分布函数的时候，一般取dr为多少？
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1楼 2008-05-21 10:05:05
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shalene

至尊木虫 (著名写手)
★ ★
lei0736(金币+1,VIP+0):谢谢
gamma337(金币+1,VIP+0):恩，
0.002-0.005nm
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2楼2008-05-21 11:23:05
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gamma337

银虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by shalene at 2008-5-21 11:23:
0.002-0.005nm

这样取有什么依据吗？
我请教过一个老师，他让我在所取的，比如是10个埃，分成一千份，然后进行统计。
按你的说法，分成200-500均份，也是很小的，一般的原子的半径都会大于1，我们取的时候难道不要把原子半径的因素考虑进去吗，分的这么小会不会造成统计结果在r上有很大的涨落？

[ Last edited by gamma337 on 2008-5-22 at 09:49 ]
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3楼2008-05-22 09:47:06
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lei0736

荣誉版主 (职业作家)

优秀版主
★
gamma337(金币+1,VIP+0):恩，有道理
不用考虑原子半径 在计算的时候不存在原子实际大小 只是一个坐标而已
分多少份看你了 分太细了曲线会有毛刺 不光滑
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4楼2008-05-22 12:20:08
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honghuzlj

木虫 (著名写手)
★
gamma337(金币+1,VIP+0):网上搜，有很多，其中DLpoly带有rdf的源程序
牛，能分享您的Fortran程序么？谢谢
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5楼2008-05-22 23:08:55
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honghuzlj

木虫 (著名写手)
我们已经找到，谢谢
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6楼2008-06-06 14:48:44
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magyi_she

请问能分享您的源程序吗？
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7楼2008-09-23 17:27:02
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xjping

金虫 (小有名气)
我觉得应该没有一定的标准吧！还要看你的体系和你需要的精度！
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8楼2008-09-26 14:51:19
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ramond.wan

能分享你的源程序吗
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9楼2008-10-08 22:54:42
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chirs8406

木虫 (著名写手)
★ ★
zzgyb(金币+2,VIP+0):谢谢你的参与，欢迎再次光临计算模拟版！
gamma337(金币+1,VIP+0):网上搜，有很多，其中DLpoly带有rdf的源程序


但是DLpoly带有rdf的源程序只适合做球状半径的，我们一般都不用，只是自己编程序，而且，dr取值是按 lei0736说的，你自己掂量着让径向分布函数不要太尖锐，液不要太多毛刺
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10楼2008-10-29 21:19:35
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