24小时热门版块排行榜    

查看: 910  |  回复: 3
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

姚韵靓8881

新虫 (初入文坛)

[求助] 文章修回的一些问题,关于SNPs 已有2人参与

本人投稿的一篇小文章最近修回,其中关于SNPs和疾病相关性的部分被审稿人提了一些问题实在看不懂,请教大家。
1.Are the frequencies obtained for the genotyped controls and RA patients in agreement with HapMap or 1000 Genome project data?
我理解是需要通过一个 HapMap或者1000 Genome project的协议啥的,但这个是什么?

2.Did the Authors consider to perform an haplotype analysis between the different blocks in Tespa1 gene?
应该是建议我做单倍体分析,但是这个完全不懂啊,请教有没有高手能够帮忙?
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

小松果2012

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
正好我们实验室就是做这个的,第一个问题,是问你的SNP分型的频率跟HapMap或者1000 Genome project(千人基因组计划)中该SNP的频率是否一致;第二个问题是让你根据该基因不同的block来做单体型分析的。
3楼2014-12-01 14:10:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 4 个回答

yangbin1

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
kx444555: 金币+3, 鼓励交流 2014-11-29 15:15:34
楼主好:
HapMap or 1000 Genome project data是两个已经完成测序的结果。 1000 Genome project好像叫千人基因组计划,之前有段时间很火。这些序列现在都公布了,NCBI上应该有。审稿人的意思是,你们的结果和这些结果是否一致。楼主可以上网查一下,这两个计划具体测了那些数据,跟你的数据之间是否可以比较。

第二个问题,你得看一下这个分析对你的文章是否有用,如果需要最好加上。要是不需要,可以跟审稿人说明没有做的原因。我这边生物信息的可以做这方面的分析。
2楼2014-11-29 14:15:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

紫阳哈哈

新虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 小松果2012 at 2014-12-01 14:10:15
正好我们实验室就是做这个的,第一个问题,是问你的SNP分型的频率跟HapMap或者1000 Genome project(千人基因组计划)中该SNP的频率是否一致;第二个问题是让你根据该基因不同的block来做单体型分析的。

请问您知道怎么研究Halotype和其他因素的交互作用吗?期待您的回答,非常感激
加油
4楼2017-12-12 13:50:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] filecode=后面第一个是大写字母 +6 wangze12014 2026-08-14 7/350 2026-08-15 20:12 by gltch
[基金申请] 有时候,自然基金真的不能太认真 (我的申报经验) +8 majunge000 2026-08-11 10/500 2026-08-15 18:55 by Equinoxhua
[基金申请] filecode +8 cratir 2026-08-14 12/600 2026-08-15 18:08 by zyfgau
[基金申请] 哪位老哥知道今年的国自然具体哪一天放榜? +7 Ldrop2023 2026-08-13 7/350 2026-08-15 15:57 by mzhh2000
[基金申请] 咱们一起用铁证分析2026国家社科基金中标与否 +7 启萌科技 2026-08-12 22/1100 2026-08-14 23:45 by Noways
[基金申请] 应该是93bebmhtak前后十一个字符比较关键 +23 Lanmanbaby 2026-08-09 37/1850 2026-08-14 13:40 by Equinoxhua
[硕博家园] 请教兼职经验 +3 是阿文鸭 2026-08-09 3/150 2026-08-14 12:07 by HER12025
[硕博家园] 读博的好处 +4 lnee 2026-08-11 4/200 2026-08-14 10:20 by ahsoarli
[基金申请] filecode +15 documentary 2026-08-10 17/850 2026-08-14 10:08 by kissu88
[基金申请] 我的国基提前知道中了,可是同事的操作让我实在接受不了,怎么会有这样的人 +10 家与远方 2026-08-10 15/750 2026-08-14 02:08 by 绵羊哥哥
[文学芳草园] 阿姨 +4 汪汪锅 2026-08-09 4/200 2026-08-13 19:43 by arzu_hma
[基金申请] 不应该看fileCode +7 且听虎啸 2026-08-12 9/450 2026-08-13 14:27 by flydreamws
[基金申请] Filecode 又变了,巨变 +3 WH3796 2026-08-12 4/200 2026-08-13 14:13 by 小木虫6752397
[基金申请] 结合人工智能,周易传统文化,filecode打分制来了,3分以上希望很大。 +3 Tide man 2026-08-12 4/200 2026-08-13 08:35 by ZJTJZ
[基金申请] 2019年青年基金涵评意见,大家看看几个A,几个B? +11 Tide man 2026-08-11 11/550 2026-08-13 07:35 by 撸猫猫
[基金申请] 综述论文作为代表作会不会影响评审专家的印象分? +11 yufeiwaner 2026-08-09 13/650 2026-08-12 08:17 by yufeiwaner
[基金申请] 帮忙看看fileCode +7 wwncly 2026-08-10 13/650 2026-08-11 19:36 by 冰心玉壶晴
[基金申请] 什么时候出结果,有咨询渠道??? +3 Tide man 2026-08-11 3/150 2026-08-11 17:54 by kudofaye
[基金申请] 确定了,国自然21号放榜 +6 布布和一二 2026-08-10 7/350 2026-08-10 19:15 by 2000zf36392
[基金申请] 据悉今年马上要出结果了 +7 瞬息宇宙 2026-08-10 8/400 2026-08-10 12:42 by Vivilian
信息提示
请填处理意见