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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 文章修回的一些问题，关于SNPs
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姚韵靓8881

新虫 (初入文坛)

[求助] 文章修回的一些问题，关于SNPs 已有2人参与

本人投稿的一篇小文章最近修回，其中关于SNPs和疾病相关性的部分被审稿人提了一些问题实在看不懂，请教大家。
1.Are the frequencies obtained for the genotyped controls and RA patients in agreement with HapMap or 1000 Genome project data?
我理解是需要通过一个 HapMap或者1000 Genome project的协议啥的，但这个是什么？

2.Did the Authors consider to perform an haplotype analysis between the different blocks in Tespa1 gene?
应该是建议我做单倍体分析，但是这个完全不懂啊，请教有没有高手能够帮忙？
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1楼 2014-11-29 13:48:01
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yangbin1

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
kx444555: 金币+3, 鼓励交流 2014-11-29 15:15:34
楼主好：
HapMap or 1000 Genome project data是两个已经完成测序的结果。 1000 Genome project好像叫千人基因组计划，之前有段时间很火。这些序列现在都公布了，NCBI上应该有。审稿人的意思是，你们的结果和这些结果是否一致。楼主可以上网查一下，这两个计划具体测了那些数据，跟你的数据之间是否可以比较。

第二个问题，你得看一下这个分析对你的文章是否有用，如果需要最好加上。要是不需要，可以跟审稿人说明没有做的原因。我这边生物信息的可以做这方面的分析。
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2楼2014-11-29 14:15:55
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小松果2012

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
正好我们实验室就是做这个的，第一个问题，是问你的SNP分型的频率跟HapMap或者1000 Genome project（千人基因组计划）中该SNP的频率是否一致；第二个问题是让你根据该基因不同的block来做单体型分析的。
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3楼2014-12-01 14:10:15
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紫阳哈哈

新虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 小松果2012 at 2014-12-01 14:10:15
正好我们实验室就是做这个的，第一个问题，是问你的SNP分型的频率跟HapMap或者1000 Genome project（千人基因组计划）中该SNP的频率是否一致；第二个问题是让你根据该基因不同的block来做单体型分析的。

请问您知道怎么研究Halotype和其他因素的交互作用吗？期待您的回答，非常感激
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加油
4楼2017-12-12 13:50:20
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