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海尤希

新虫 (小有名气)

[求助] pull down 实验中蛋白聚体问题 已有2人参与

最近在做体外pull down的过程中遇到了一些问题,想各位有经验的人请教一下,我都只是用SDS-PAGE检测了下。
1、用于pull down实验的蛋白需要考虑其聚体形式吗?我之前都是从金属离子亲和层析纯化后就直接做GST pull down,没有考察蛋白是否多聚(GST fusion的应该一般容易聚),没有做出来。是否有必要进一步明确蛋白聚体或提高buffe盐浓度之类的再试一试。
2、有人会做正反都试一下(即GST-proteinX+proteinY,proteinX+GST-proteinY),可能是因为考虑到GST对蛋白的辅助折叠功能太强,改变其实际的折叠。我不知道这么做是否有必要?
期待大家的回复!
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冷静、加油。
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jurkat.1640

至尊木虫 (文坛精英)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
GST太大,做纯化可以,做蛋白相互作用不合适。
2楼2014-12-01 08:37:18
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海尤希

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by jurkat.1640 at 2014-12-01 08:37:18
GST太大,做纯化可以,做蛋白相互作用不合适。

但GST pull down好像还蛮普遍的,而且我参考的一篇文献就是这么做的,只不过他用了western检测,你们实验室做相互作用都怎么做?
冷静、加油。
3楼2014-12-01 10:57:30
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jurkat.1640

至尊木虫 (文坛精英)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 海尤希 at 2014-12-01 10:57:30
但GST pull down好像还蛮普遍的,而且我参考的一篇文献就是这么做的,只不过他用了western检测,你们实验室做相互作用都怎么做?...

3×Flag标签
4楼2014-12-01 11:11:29
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小小技术官

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

GST本身会有二聚的,如果你的两种蛋白都是GST标签的话,结果就不可信
生活是一面镜子,要笑着面对!
5楼2014-12-01 16:46:41
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