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newton3915

铁杆木虫 (正式写手)

[求助] Siesta编译没有报错，但是一运行就出问题 已有1人参与

Siesta编译没有报错，但是一运行就出现如下错误forrtl: severe (174): SIGSEGV, segmentation fault occurred，求助高手怎么解决。下面是我的arch.make文件。不胜感激！！


#
.SUFFIXES:
.SUFFIXES: .f .F .o .a .f90 .F90

SIESTA_ARCH=x86_64-unknown-linux-gnu--unknown

FPP=
FPP_OUTPUT=
FC=/usr/local/openmpi/intel/bin/mpif90
RANLIB=ranlib

SYS=nag

SP_KIND=4
DP_KIND=8
KINDS=$(SP_KIND) $(DP_KIND)

FFLAGS=-g -O2
FPPFLAGS= -DMPI -DFC_HAVE_FLUSH -DFC_HAVE_ABORT -DGRID_DP
LDFLAGS=

ARFLAGS_EXTRA=

FCFLAGS_fixed_f=
FCFLAGS_free_f90=
FPPFLAGS_fixed_F=
FPPFLAGS_free_F90=

BLAS_LIBS=$(MKLROOT)/lib/intel64/libmkl_blas95_lp64.a
LAPACK_LIBS=$(MKLROOT)/lib/intel64/libmkl_lapack95_lp64.a
BLACS_LIBS=$(MKLROOT)/lib/intel64//libmkl_blacs_openmpi_lp64.a
SCALAPACK_LIBS=$(MKLROOT)/lib/intel64/libmkl_scalapack_lp64.a
MKL_LIBS=-Wl,--start-group $(MKLROOT)/lib/intel64/libmkl_intel_lp64.a $(MKLROOT)/lib/intel64/libmkl_core.a $(MKLROOT)/lib/intel6
4/libmkl_sequential.a -Wl,--end-group $(BLACS_LIBS) -lpthread -lm

COMP_LIBS=

NETCDF_LIBS=
NETCDF_INTERFACE=

LIBS=$(SCALAPACK_LIBS) $(BLACS_LIBS) $(LAPACK_LIBS) $(BLAS_LIBS) $(MKL_LIBS) $(NETCDF_LIBS)

#SIESTA needs an F90 interface to MPI
#This will give you SIESTA's own implementation
#If your compiler vendor offers an alternative, you may change
#to it here.
MPI_INTERFACE= libmpi_f90.a
MPI_INCLUDE=/usr/local/openmpi/intel/include

#Dependency rules are created by autoconf according to whether
#discrete preprocessing is necessary or not.
.F.o:
        $(FC) -c $(FFLAGS) $(INCFLAGS) $(FPPFLAGS) $(FPPFLAGS_fixed_F)  $<
.F90.o:
        $(FC) -c $(FFLAGS) $(INCFLAGS) $(FPPFLAGS) $(FPPFLAGS_free_F90) $<
.f.o:
        $(FC) -c $(FFLAGS) $(INCFLAGS) $(FCFLAGS_fixed_f)  $<
.f90.o:
        $(FC) -c $(FFLAGS) $(INCFLAGS) $(FCFLAGS_free_f90)  $<
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1楼 2014-11-27 22:40:37
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newton3915

铁杆木虫 (正式写手)
顶起
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2楼2014-11-28 09:50:33
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newton3915

铁杆木虫 (正式写手)
upupup
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3楼2014-11-29 06:40:24
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valenhou001

至尊木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
newton3915: 金币+20, ★★★★★最佳答案 2014-11-29 09:26:24
降低FFLAGS=-g -O2里的优化选项-O2，去掉它或试试。

还有可能是编译选项里有关blas, lapack, scalpack库链接的问题。根据的机器类型以及编译器版本，参考Intel® Math Kernel Library Link Line Advisor
在线工具给出的链接选项来修改你的arch.make，然后重新编译了。
https://software.intel.com/en-us ... l-link-line-advisor
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4楼2014-11-29 09:04:50
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newton3915

铁杆木虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by valenhou001 at 2014-11-29 09:04:50
降低FFLAGS=-g -O2里的优化选项-O2，去掉它或试试。

还有可能是编译选项里有关blas, lapack, scalpack库链接的问题。根据的机器类型以及编译器版本，参考Intel® Math Kernel Library Link Line Advisor
在 ...

去掉-O2选项真的解决了问题，非常感谢！ 不过为什么在我自己的电脑上-O2没问题，在服务器上不行呢，这个-O2选项会影响速度吗？
赞一下 回复此楼
5楼2014-11-29 09:25:36
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valenhou001

至尊木虫 (职业作家)
引用回帖:
5楼: Originally posted by newton3915 at 2014-11-29 10:25:36
去掉-O2选项真的解决了问题，非常感谢！ 不过为什么在我自己的电脑上-O2没问题，在服务器上不行呢，这个-O2选项会影响速度吗？...

可能略会影响速度。但不是很明显。
赞一下 回复此楼
6楼2014-11-29 10:09:47
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newton3915

铁杆木虫 (正式写手)
引用回帖:
6楼: Originally posted by valenhou001 at 2014-11-29 10:09:47
可能略会影响速度。但不是很明显。...

嗯嗯 多谢多谢
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7楼2014-11-29 10:20:20
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