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铁虫 (初入文坛)

[求助] 3‘RACE电泳图跑成这样是怎么回事,求高手们指点一下,迷茫 已有1人参与

我用的是巢式PCR法做的RACE,两次结果,产物都积在胶孔处,求教做过3’RACE的朋友们这是怎么回事呢,很迷茫,做不出来。
前4个是第三次PCR结果,后两个是第二轮PCR结果。
4)PCR反应程序如下
第一次PCR:
cDNA                        2 μL
10×PCR buffer          2 .5μL
Ex Taq HS                0.2 μL
dNTP (10 mmol·L-1)        0.3 μL
GSP-F1                          0.5 μL
M13 Primer M4                  0.5 μL
超纯H2O                          18.1 μL
总体积                          25 μL
反应条件为: 95℃ 5min;95℃ 30s,65℃ 30s,72℃ 1min,3 个循环;95℃ 30s,62℃ 30s,72℃ 1min,3 个循环;95℃ 30s,59℃ 30s,72℃ 1min,3 个循环;95℃ 30s,56℃ 30s,72℃ 1min,3 个循环;95℃ 30s,53℃ 30s,72℃ 1min,25 个循环;72℃延伸10min,最后4℃保存。
第二轮和第三轮PCR反应分别以上一轮PCR反应的产物为底物,未稀释,程序、体系一样。

3‘RACE电泳图跑成这样是怎么回事,求高手们指点一下,迷茫
IMG_20141120_112123.jpg
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昺昺

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
这种情况没有遇到过。1 第一轮PCR的cDNA模板浓度和质量怎么样,建议将模板浓度控制到所用聚合酶的适用范围,大部分是50-100ng;2 PCR产物作模板时,我一般先将PCR产物纯化,再稀释到合适的浓度。
建议浅薄,多联系
太阳出来,星星要走。
2楼2014-11-21 13:45:00
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973762089

铁虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 昺昺 at 2014-11-21 13:45:00
这种情况没有遇到过。1 第一轮PCR的cDNA模板浓度和质量怎么样,建议将模板浓度控制到所用聚合酶的适用范围,大部分是50-100ng;2 PCR产物作模板时,我一般先将PCR产物纯化,再稀释到合适的浓度。
建议浅薄,多联系

明白了,谢谢!
3楼2014-11-21 14:22:31
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