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kimichen

银虫 (初入文坛)

[求助] 羧酸配合物晶体结构 已有3人参与

求助各位晶体大神,小弟最近做了一个羧酸类的稀土配合物,晶体结构显示羧基的两个氧原子均成功与稀土离子配位,但同时羧基上的碳原子也与稀土离子成键,而且在cif文件中找到了M-C键的键长数据。小硕一枚,文献积累也不多,没发现过这种配位形式。求助各位大神,给小弟点建议!
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evilbat

铁虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
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kimichen(TonyGeN代发): 金币+3, 感谢热情应助 欢迎常来晶体版 2014-11-22 09:39:03
这个直接删掉refine or XL就行了
或者ins里面加 free C(编号) Ln(编号)
2楼2014-11-20 20:13:11
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p452_1

至尊木虫 (知名作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
kimichen(TonyGeN代发): 金币+3, 感谢热情应助 欢迎常来晶体版 2014-11-22 09:39:18
如果你确定金属原子和配体原子正确,就不需要管稀土和C的键,直接精修就可以。
后头在画图时候,把稀土与炭形成的键删掉,只保留稀土和氧原子的化学键就行了。
老歪博
3楼2014-11-20 21:15:49
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jackdeng

专家顾问 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
kimichen(TonyGeN代发): 金币+3, 感谢热情应助 欢迎常来晶体版 2014-11-22 09:39:35
按照你的描述,是不是说某一个羧基的C和两个O同时与稀土离子配位了??如果是的话,这样的金属-碳键是不正确的,无须在意cif文件中是否有这个键长,画图的时候把它去掉就可以了。
4楼2014-11-21 08:09:29
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xwnail2003

禁虫 (著名写手)

本帖内容被屏蔽

5楼2014-11-21 10:51:33
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kimichen

银虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by jackdeng at 2014-11-21 08:09:29
按照你的描述,是不是说某一个羧基的C和两个O同时与稀土离子配位了??如果是的话,这样的金属-碳键是不正确的,无须在意cif文件中是否有这个键长,画图的时候把它去掉就可以了。

“这样的金属-碳键是不正确的” 是为什么呢?还望大侠不吝赐教!
6楼2014-11-21 20:30:01
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jackdeng

专家顾问 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
kimichen(TonyGeN代发): 金币+3, 感谢热情应助 欢迎常来晶体版 2014-11-22 09:39:52
kimichen: 金币+8, ★★★★★最佳答案 2014-11-24 10:43:44
引用回帖:
6楼: Originally posted by kimichen at 2014-11-21 20:30:01
“这样的金属-碳键是不正确的” 是为什么呢?还望大侠不吝赐教!...

基本的配位化学知识,如果算成键,键角太小,斥力过大,是不能稳定存在的。

[ 发自小木虫客户端 ]
7楼2014-11-22 06:37:06
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lucifacarbon

铜虫 (小有名气)

undo 稀土和c就可以了,
8楼2014-11-22 15:16:42
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