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jolly1987金虫 (小有名气)
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关于GROMACS官网教程KALP15 in DPPC学习问题求助
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教程地址： http://www.bevanlab.biochem.vt.e ... ein/03_solvate.html 此教程做到Step Three: Defining the Unit Cell & Adding Solvent 要先生成一个dppc128.gro文件，然后用grompp生成em.tpr文件 gmx editconf -f dppc128.pdb -pbc -o dppc128.gro gmx grompp -f minim.mdp -c dppc128.gro -p topol_dppc.top -o em.tpr 提示： Fetal error: Atomtype CA not found For more information an tips for troubleshooting, please check the CROMACS website...... 但是根据提示检查了ffnonbonded.itp, CA原子是有定义的，而且输入的dppc128.gro文件中没有CA原子，请问这是怎么回事？ 新手学习，望大家多多指教！谢谢 |
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2楼2014-11-20 23:09:24
jolly1987
金虫 (小有名气)
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3楼2014-11-21 14:22:38
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