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辐照损伤模拟求助
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我看好多文献都是在不考虑极化的条件下，用硬球模型（rigid ion model）做分子动力学模拟，我在做的时候就是没有用rigid和shell参数，把所有原子看成的自由粒子，但是在计算完以后用VMD看了一下，加能量的原子是穿透其他原子直线前进的，我分析原因可能有两个：1）硬球模型加载可能错误，不知POLY应用硬球模式是否还需要设置一些参数；2）我算的时候只是用了Buckingham势能做了一个初步的模拟，没有加ZBL。 不知各位有没有遇到过这种情况的，能否请教一下，在此谢过。 |
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