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但丁

木虫 (小有名气)

[求助] 辐照损伤模拟求助

我看好多文献都是在不考虑极化的条件下,用硬球模型(rigid ion model)做分子动力学模拟,我在做的时候就是没有用rigid和shell参数,把所有原子看成的自由粒子,但是在计算完以后用VMD看了一下,加能量的原子是穿透其他原子直线前进的,我分析原因可能有两个:1)硬球模型加载可能错误,不知POLY应用硬球模式是否还需要设置一些参数;2)我算的时候只是用了Buckingham势能做了一个初步的模拟,没有加ZBL。
不知各位有没有遇到过这种情况的,能否请教一下,在此谢过。
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