24小时热门版块排行榜    

查看: 366  |  回复: 6
当前主题已经存档。
【有奖交流】积极回复本帖子,参与交流,就有机会分得作者 yqlyql 的 50 个金币

yqlyql

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助】问题已经解决。谢谢sunmuer 兄弟。请版主帮手转移金币。谢谢

各位朋友,我使用随机噬菌体12肽库找到了一堆和已知的受体结合的12肽,现在想进一步分析其亲和力,受体的PDB文件已经找到了,但是我在12肽库中找的短肽由于不曾有过,所以找不到pdb文件,不知道大家有什么办法解决。
谢谢了。

[ Last edited by yqlyql on 2008-5-13 at 13:29 ]
回复此楼
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sunmuer

木虫 (小有名气)

★ ★
zzgyb(金币+2,VIP+0):谢谢你的参与,欢迎继续关注计算模拟版!
你可以自己画一个12肽,也就是自己建模,然后保存成PDB格式的.最好建模以后,优化一下.
这类建模的工具应该有不少免费的.
出清水而不染
2楼2008-05-12 06:50:52
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yqlyql

银虫 (小有名气)

是啊,只是我是学医学的,对这些空间结构实在不懂,各位能不能帮手画一下,
http://davapc1.bioch.dundee.ac.uk/programs/prodrg/
我知道这个地方可以画。

我的多肽是线性的
HYGMTHPNTMSH  和  SPGLSLVSHMQT
谢谢了
3楼2008-05-12 11:39:27
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yqlyql

银虫 (小有名气)

各位兄弟,能不能帮帮忙阿
4楼2008-05-12 22:02:52
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sunmuer

木虫 (小有名气)

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ...
lei0736(金币+3,VIP+0):谢谢
zzgyb(金币+50,VIP+0):谢谢你的帮助,楼主奖励你,欢迎继续关注计算模拟版!
引用回帖:
Originally posted by yqlyql at 2008-5-12 11:39:
是啊,只是我是学医学的,对这些空间结构实在不懂,各位能不能帮手画一下,
http://davapc1.bioch.dundee.ac.uk/programs/prodrg/
我知道这个地方可以画。

我的多肽是线性的
HYGMTHPNTMSH  和  ...

在附件里,2个pdb文件。
出清水而不染
5楼2008-05-13 07:39:10
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

chemhz

铁杆木虫 (正式写手)

★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):鼓励新人
个人认为,Autodock对于多肽-受体之间的计算支持并不是很好。尤其是12肽这么大的配体。其计算的亲和性数据参考价值不大。你可以采用别的软件来代替,比如可以用protein-protein相关的软件。
6楼2008-05-13 09:22:32
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yqlyql

银虫 (小有名气)

谢谢sunmuer,我想sunmuer兄弟主要是出于一种助人的心来帮助我,并不是为金币而来,非常感谢。
请斑竹帮手转移金币。谢谢
同时也谢谢 chemhz 的建议
7楼2008-05-13 13:26:25
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 yqlyql 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[硕博家园] 售SCI一区文章,我:8 O5 51O 54,科目齐全,可+急 +3 8rmuugja8q 2026-02-22 7/350 2026-02-23 09:44 by w4l55oybr1
[考研] 售SCI一区文章,我:8 O5 51O 54,科目齐全,可+急 +3 khieu8v8m0 2026-02-22 8/400 2026-02-23 09:35 by w4l55oybr1
[论文投稿] 售SCI一区文章,我:8 O5 51O 54,科目齐全,可+急 +4 khieu8v8m0 2026-02-22 8/400 2026-02-23 09:29 by w4l55oybr1
[考研] 售SCI一区文章,我:8 O5 51O 54,科目齐全,可+急 +5 usprnugpzw 2026-02-21 11/550 2026-02-23 09:24 by w4l55oybr1
[教师之家] 为什么中国大学工科教授们水了那么多所谓的顶会顶刊,但还是做不出宇树机器人? +5 欢乐颂叶蓁 2026-02-21 8/400 2026-02-23 09:19 by 欢乐颂叶蓁
[论文投稿] 售SCI一区文章,我:8 O5 51O 54,科目齐全,可+急 +3 w89i99eaeh 2026-02-22 5/250 2026-02-23 08:04 by w4l55oybr1
[博后之家] 售SCI一区文章,我:8 O5 51O 54,科目齐全,可+急 +6 3dfhjxgsh7 2026-02-22 9/450 2026-02-23 07:49 by w4l55oybr1
[考博] 售SCI一区文章,我:8 O5 51O 54,科目齐全,可+急 +4 khieu8v8m0 2026-02-22 4/200 2026-02-23 06:46 by jsjzfl
[公派出国] 售SCI一区文章,我:8 O5 51O 54,科目齐全,可+急 +3 khieu8v8m0 2026-02-22 5/250 2026-02-23 06:29 by w4l55oybr1
[硕博家园] 售SCI一区文章,我:8 O5 51O 54,科目齐全,可+急 +4 khieu8v8m0 2026-02-22 8/400 2026-02-23 06:24 by w4l55oybr1
[考博] 售SCI一区文章,我:8 O5 51O 54,科目齐全,可+急 +5 3dfhjxgsh7 2026-02-22 6/300 2026-02-23 02:04 by 5jlh3qtdvx
[教师之家] 版面费该交吗 +7 苹果在哪里 2026-02-22 8/400 2026-02-22 22:37 by otani
[论文投稿] 售SCI一区文章,我:8 O5 51O 54,科目齐全,可+急 +4 usprnugpzw 2026-02-21 6/300 2026-02-22 19:48 by w89i99eaeh
[考研] 售SCI一区文章,我:8 O5 51O 54,科目齐全,可+急 +3 3dfhjxgsh7 2026-02-22 4/200 2026-02-22 16:52 by khieu8v8m0
[找工作] 售SCI一区文章,我:8 O5 51O 54,科目齐全,可+急 +3 usprnugpzw 2026-02-22 3/150 2026-02-22 16:37 by khieu8v8m0
[公派出国] 售SCI一区文章,我:8 O5 51O 54,科目齐全,可+急 +3 usprnugpzw 2026-02-21 4/200 2026-02-22 16:27 by khieu8v8m0
[基金申请] “人文社科而论,许多学术研究还没有达到民国时期的水平” +4 苏东坡二世 2026-02-18 5/250 2026-02-22 16:07 by liangep1573
[基金申请] 什么是人一生最重要的? +4 瞬息宇宙 2026-02-21 4/200 2026-02-22 11:44 by huagongfeihu
[基金申请] 今年春晚有几个节目很不错,点赞! +11 瞬息宇宙 2026-02-16 12/600 2026-02-21 21:14 by lq493392203
[基金申请] 体制内长辈说体制内绝大部分一辈子在底层,如同你们一样大部分普通教师忙且收入低 +9 瞬息宇宙 2026-02-20 12/600 2026-02-21 10:39 by 欢乐颂叶蓁
信息提示
请填处理意见