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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » 扩散系数值模拟与实验相差很大
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敏sunflower

金虫 (小有名气)
引用回帖:
28楼: Originally posted by 邴绍所 at 2014-11-14 08:51:17
真心的祝福你，
真心的祝福你。

谢谢！
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31楼2014-11-14 10:52:12
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敏sunflower

金虫 (小有名气)
引用回帖:
27楼: Originally posted by 阿Q~~ at 2014-11-14 08:44:31
帮顶一下，不懂 ~~~~~~~~~~~~~

谢谢
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32楼2014-11-14 10:52:22
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敏sunflower

金虫 (小有名气)
自己顶一下，希望帖子不要石沉大海啊！望各位大侠帮帮小妹！
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33楼2014-11-14 10:54:49
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敏sunflower

金虫 (小有名气)
引用回帖:
26楼: Originally posted by lsloneil at 2014-11-14 08:13:49
你可以试试固定一部分原子么？比如说只固定backbone。...

我想问一下，即使不固定原子应该也可以吧，我只是想看看分子在高分子膜表面的运动情况，只要能看到原料液分子明显的运动趋势就可以了吧？
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34楼2014-11-14 11:09:16
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gaupay

至尊木虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
25楼: Originally posted by 敏sunflower at 2014-11-13 15:49:07
我做的时候如果固定高分子的所有原子的话，动力学就无法进行了。但是不固定的话，动力学之后就会发现，高分子体系会移动位置，...

因为我需要观察界面现象，所以对基层原子全部固定，如果做扩散的话，应该不要固定吧。高分子体系移动也是合理的。
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Godblessgoodman
35楼2014-11-14 11:30:35
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敏sunflower

金虫 (小有名气)
引用回帖:
35楼: Originally posted by gaupay at 2014-11-14 11:30:35
因为我需要观察界面现象，所以对基层原子全部固定，如果做扩散的话，应该不要固定吧。高分子体系移动也是合理的。...

哦，好的
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36楼2014-11-14 12:19:23
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敏sunflower

金虫 (小有名气)
又增加金币了呦！！！
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37楼2014-11-14 15:50:31
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lsloneil

专家顾问 (正式写手)
★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
敏sunflower: 金币+3 2014-11-15 10:09:20
引用回帖:
34楼: Originally posted by 敏sunflower at 2014-11-13 15:09:16
我想问一下，即使不固定原子应该也可以吧，我只是想看看分子在高分子膜表面的运动情况，只要能看到原料液分子明显的运动趋势就可以了吧？...

很多时候固定哪一部分是很主观的选择，具体取决于你想观察什么性质，想观察在什么构型下体系的哪些性质。我不太了解你到底想观察体系的什么性质，根据我个人的经验，如果是想观察液体在高分子表面的密度分布，那么固定整个高分子或者至少backbone可以算是一个选择，这样的话高分子就被固定成了一个表面，并可以进而计算液体的密度随距离表面距离的变化。但如果是研究扩散，如果把整个高分子固定，液体往高分子表面的运动完全就阻碍住了，这种情况下扩散是受限的，有时可能不是我们所需要的（因为我们有时想观察自由扩散）。
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38楼2014-11-15 04:54:45
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敏sunflower

金虫 (小有名气)
引用回帖:
38楼: Originally posted by lsloneil at 2014-11-15 04:54:45
很多时候固定哪一部分是很主观的选择，具体取决于你想观察什么性质，想观察在什么构型下体系的哪些性质。我不太了解你到底想观察体系的什么性质，根据我个人的经验，如果是想观察液体在高分子表面的密度分布，那么 ...

恩恩，好的，非常感谢！
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39楼2014-11-15 10:09:15
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敏sunflower

金虫 (小有名气)
大家对于我的问题有何高见啊？急需各位的帮助啊!!!
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40楼2014-11-15 10:10:35
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