| 查看: 1841 | 回复: 0 | ||
[求助]
pwscf做半导体晶胞结构优化
|
|
我建立的是半导体超晶胞模型，表面有一个团簇模型吸附，想先做结构优化再进行其他计算，in文件如下： &CONTROL calculation= "vc-relax", restart_mode='from_scratch' prefix= "cds", pseudo_dir= "/vol6/home/zhang00/pseudo1", outdir= "./", tprnfor =.true, nstep =50, etot_conv_thr =1.0E-6, forc_conv_thr =1.0D-5, dt =50, / &SYSTEM ibrav=0,celldm(1)=7.552000,nat=52,ntyp=4, ecutwfc=40,ecutrho=400, occupations ='smearing', smearing ='mp', degauss =0.025, / &ELECTRONS conv_thr= 1.D-6, mixing_beta= 0.7D0, / &IONS / &CELL cell_dynamics ='bfgs' / ATOMIC_SPECIES O 16.00 O.pbe-n-rrkjus_psl.0.1.UPF S 32.00 S.pbe-n-rrkjus_psl.0.1.UPF Ti 48.00 Ti.pbe-sp-van_ak.UPF Cd 112.40 Cd.pbe-n-van.UPF ATOMIC_POSITIONS crystal O 0.000000 0.000000 0.000000 O 0.250000 0.250000 0.264805 。。。。。这里省略其它的 K_POINTS automatic 3 3 2 0 0 0 CELL_PARAMETERS 7.5520000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 7.5520000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 17.9113240 之后提交服务器任务，计算输出结果如下： Initial potential from superposition of free atoms Check: negative starting charge= -0.185650 starting charge 403.99853, renormalised to 420.00000 negative rho (up, down): 0.193E+00 0.000E+00 yhrun: error: cn2411: task 0: Killed yhrun: First task exited 60s ago yhrun: tasks 1-5: running yhrun: task 0: exited abnormally yhrun: Terminating job step 747818.0 slurmd[cn2411]: *** STEP 747818.0 KILLED AT 2014-11-04T17:03:06 WITH SIGNAL 9 *** yhrun: Job step aborted: Waiting up to 2 seconds for job step to finish. slurmd[cn2411]: *** STEP 747818.0 KILLED AT 2014-11-04T17:03:06 WITH SIGNAL 9 *** 前面读取信息都没有问题啊，到这里开始进行计算，任务直接就killed的，求高人帮看看是什么问题啊，赝势文献选择？k-point设置？还是截断能？ 还是其它值设定问题？ 还有occupations这一项，我的是半导体，这个值该选择什么呢？smearing不是针对金属么？tetrahedra这个只说适合计算DOS啊？做结构优化计算，对于原子间力，离子力，压力这些都必须要进行计算么？收敛值的选择该怎么确定呢？  |
回复此楼» 猜你喜欢
今年审到国自然15份，谈谈感受
已经有15人回复
-
国自然上会要求
已经有5人回复
-
面上本子正文33页，违规吗？会被低分嘛？
已经有7人回复
-
上海大学实验技术岗位非升即走
已经有8人回复
-
考博自荐
已经有6人回复
-
青C资助名额大幅增加！
已经有16人回复
-
重磅！青年科学基金项目（C类）资助增幅预计超过50%
已经有10人回复
-
我在等一个没有答案的答案
已经有3人回复
-
半夜喝咖啡
已经有5人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急
已经有4人回复
找到一些相关的精华帖子，希望有用哦~
从M-S plot得到半导体的能级谱图的疑问
已经有12人回复
- 半导体掺杂费米能级不移动，求高手指点
已经有7人回复
- 关于pwscf进行优化的问题
已经有5人回复
- ELK简单计算失败，求高手解答！
已经有4人回复
- 晶格弛豫与结构弛豫
已经有18人回复
- 急求！做半导体材料的CV曲线求材料的HOMO，LUMO能级时溶剂的选择问题
已经有7人回复
- 是否有软件可实现沿PWscf计算得到的某一声子振动方向来调节晶格中的原子位置
已经有5人回复
- 同一结构，vasp和castep计算band structure，结果是相同的还是不同的？
已经有7人回复
- PWSCF可以计算半导体材料费米能级变化吗？
已经有19人回复
- 【求助】pwscf结构优化中结果出的怪异啊
已经有16人回复
- 【原创】第一原理计算的一些心得
已经有160人回复
- 【求助】用PWSCF中的LDA+U做反铁磁绝缘体系的弛豫计算
已经有23人回复
- 【求助】请教PWSCF晶体建模和自洽计算，不收敛
已经有21人回复
- 【求助】Pwscf计算下的fractional coordinate
已经有5人回复
- 【分享】借助MS建立abinit结构文件
已经有37人回复
点击这里搜索更多相关资源科研从小木虫开始，人人为我，我为人人
20