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pwscf做半导体晶胞结构优化
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我建立的是半导体超晶胞模型，表面有一个团簇模型吸附，想先做结构优化再进行其他计算，in文件如下： &CONTROL calculation= "vc-relax", restart_mode='from_scratch' prefix= "cds", pseudo_dir= "/vol6/home/zhang00/pseudo1", outdir= "./", tprnfor =.true, nstep =50, etot_conv_thr =1.0E-6, forc_conv_thr =1.0D-5, dt =50, / &SYSTEM ibrav=0,celldm(1)=7.552000,nat=52,ntyp=4, ecutwfc=40,ecutrho=400, occupations ='smearing', smearing ='mp', degauss =0.025, / &ELECTRONS conv_thr= 1.D-6, mixing_beta= 0.7D0, / &IONS / &CELL cell_dynamics ='bfgs' / ATOMIC_SPECIES O 16.00 O.pbe-n-rrkjus_psl.0.1.UPF S 32.00 S.pbe-n-rrkjus_psl.0.1.UPF Ti 48.00 Ti.pbe-sp-van_ak.UPF Cd 112.40 Cd.pbe-n-van.UPF ATOMIC_POSITIONS crystal O 0.000000 0.000000 0.000000 O 0.250000 0.250000 0.264805 。。。。。这里省略其它的 K_POINTS automatic 3 3 2 0 0 0 CELL_PARAMETERS 7.5520000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 7.5520000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 17.9113240 之后提交服务器任务，计算输出结果如下： Initial potential from superposition of free atoms Check: negative starting charge= -0.185650 starting charge 403.99853, renormalised to 420.00000 negative rho (up, down): 0.193E+00 0.000E+00 yhrun: error: cn2411: task 0: Killed yhrun: First task exited 60s ago yhrun: tasks 1-5: running yhrun: task 0: exited abnormally yhrun: Terminating job step 747818.0 slurmd[cn2411]: *** STEP 747818.0 KILLED AT 2014-11-04T17:03:06 WITH SIGNAL 9 *** yhrun: Job step aborted: Waiting up to 2 seconds for job step to finish. slurmd[cn2411]: *** STEP 747818.0 KILLED AT 2014-11-04T17:03:06 WITH SIGNAL 9 *** 前面读取信息都没有问题啊，到这里开始进行计算，任务直接就killed的，求高人帮看看是什么问题啊，赝势文献选择？k-point设置？还是截断能？ 还是其它值设定问题？ 还有occupations这一项，我的是半导体，这个值该选择什么呢？smearing不是针对金属么？tetrahedra这个只说适合计算DOS啊？做结构优化计算，对于原子间力，离子力，压力这些都必须要进行计算么？收敛值的选择该怎么确定呢？  |
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