应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 综合其他 » 关于CHIP-seq样品打断的疑问
51/1返回列表
查看: 2477  |  回复: 8
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

fanfan3570

新虫 (初入文坛)

[求助] 关于CHIP-seq样品打断的疑问 已有1人参与

之前同事做CHIP（染色质免疫沉淀技术），都是用的宁波新芝的打断仪，效果不错，都能打到DNA片段在200-500bp，现在不知道是打断仪的问题还是什么问题，DNA片段一直打不下来。实验室还有一台新买的Covaris的打断仪，供应商说可以用来处理CHIP样品的，但是我们自己做的时候，发现片段还是打不下了，不知道是什么原因？
     坛子里不晓得有没有做过二代测序的，你们做CHIP-seq的时候用什么仪器打断的，有用宁波新芝的细胞破碎仪或者Covaris M220的麻烦回复一下，多谢了
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2014-10-31 11:32:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fanfan3570

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
6楼: Originally posted by rb at 2014-11-07 12:19:04
不同片段的，参数完全不同的。需要自己试几个的。CHIP-seq的需要的高频的，自己还是要摸索一下，由于高频时间长记住中间要去水加冰的。...

那你们用的是什么仪器呀？
赞一下 回复此楼
7楼2014-11-07 14:43:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 9 个回答

jackiey2

铜虫 (正式写手)
应该是交联过度了，减少交联时间试试。
赞一下(1人) 回复此楼
遗传
2楼2014-10-31 22:02:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

rb

木虫 (著名写手)

小笨虫虫

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
fanfan3570: 金币+3 2014-11-07 10:34:21
温度，时间，频率 打小片段用high档。记住冰水混合物的冰占水面80%。
Covaris还凑合的。
赞一下(1人) 回复此楼
寝室楼的大爷、大妈都是哲学家，他们每天都在思考人类最根本的三个问题：你是谁？你从哪儿来？要去哪儿？
3楼2014-10-31 23:54:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fanfan3570

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by rb at 2014-10-31 23:54:57
温度，时间，频率 打小片段用high档。记住冰水混合物的冰占水面80%。
Covaris还凑合的。

想问一下，你们之前用Covaris打断过吗？如果打断过，能不能把参数告诉我们呀
赞一下 回复此楼
4楼2014-11-07 10:32:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 9 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[公派出国] 售SCI一区文章，我:8 O5 51O 54,科目齐全 +3 5lbyq5wrhb 2026-02-07 3/150 2026-02-08 03:05 by vs90ilomwc
[考博] 售SCI一区文章，我:8 O5 51O 54,科目齐全 +3 5lbyq5wrhb 2026-02-07 3/150 2026-02-08 02:52 by vs90ilomwc
[论文投稿] 售SCI一区文章，我:8 O5 51O 54,科目齐全 +3 3rkserf6qr 2026-02-07 4/200 2026-02-08 02:45 by vs90ilomwc
[硕博家园] 售SCI一区文章，我:8 O5 51O 54,科目齐全 +3 3rkserf6qr 2026-02-07 3/150 2026-02-08 02:32 by vs90ilomwc
[考博] 售SCI一区文章，我:8 O5 51O 54,科目齐全 +5 2h7du0nuhk 2026-02-07 5/250 2026-02-08 02:25 by vs90ilomwc
[硕博家园] 售SCI一区文章，我:8 O5 51O 54,科目齐全 +4 2h7du0nuhk 2026-02-07 5/250 2026-02-08 02:12 by vs90ilomwc
[考博] 售SCI一区文章，我:8 O5 51O 54,科目齐全 +4 2h7du0nuhk 2026-02-07 6/300 2026-02-08 02:07 by vs90ilomwc
[教师之家] 售SCI一区文章，我:8 O5 51O 54,科目齐全 +4 2h7du0nuhk 2026-02-07 6/300 2026-02-08 02:05 by vs90ilomwc
[找工作] 售SCI一区文章，我:8 O5 51O 54,科目齐全 +4 2h7du0nuhk 2026-02-07 6/300 2026-02-08 01:46 by vs90ilomwc
[考博] 售SCI一区文章，我:8 O5 51O 54,科目齐全 +4 2h7du0nuhk 2026-02-07 7/350 2026-02-08 01:32 by vs90ilomwc
[硕博家园] 售SCI一区文章，我:8 O5 51O 54,科目齐全 +4 2h7du0nuhk 2026-02-07 7/350 2026-02-08 01:12 by vs90ilomwc
[教师之家] 有院领导为了换新车，用横向课题经费买了俩车 +7 瞬息宇宙 2026-02-04 7/350 2026-02-07 21:47 by tfang
[有机交流] 酰胺脱乙酰基 10+5 chibby 2026-02-03 12/600 2026-02-07 19:29 by 江东闲人
[基金申请] 同年申请2项不同项目，第1个项目里不写第2个项目的信息，可以吗 +4 hitsdu 2026-02-06 4/200 2026-02-07 13:07 by jurkat.1640
[基金申请] 有时候真觉得大城市人没有县城人甚至个体户幸福 +9 苏东坡二世 2026-02-04 10/500 2026-02-07 12:37 by 小毛球
[考博] 天津大学招2026.09的博士生，欢迎大家推荐交流（博导是本人） +4 a793625982 2026-02-05 5/250 2026-02-07 10:57 by a793625982
[公派出国] CSC & MSCA 博洛尼亚大学能源材料课题组博士/博士后招生｜MSCA经费充足、排名优 +4 雨念 2026-02-01 6/300 2026-02-06 23:32 by MelissaPon
[基金申请] 面上项目申报 +3 Tide man 2026-02-01 3/150 2026-02-05 22:56 by god_tian
[硕博家园] 博士延得我，科研能力直往上蹿 +7 偏振片 2026-02-02 7/350 2026-02-04 17:36 by 陈氏帝国
[教师之家] 遇见不省心的家人很难过 +18 otani 2026-02-03 22/1100 2026-02-04 11:06 by tangmnt
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭