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荷西树

新虫 (小有名气)

[求助] 分子动力学的缺点已有1人参与

文章一篇分子动力学和实验结合的文章,审稿人纠结在为什么模拟温度跟实验温度不一致。想请大牛帮分析一下分子动力学的缺点或者给几篇文献作为佐证。谢谢
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荷西树

新虫 (小有名气)

引用回帖:
11楼: Originally posted by ChemiAndy at 2014-10-31 03:11:11
有意思。既然反应是有温度选择性的,这背后一定有很有意思的东西可以挖掘。你的模拟目的如果是尝试解释此机理,那温度的选择就必然是个关键因素,审稿人要求进一步解释是合理的。当然分子模拟这种反应是有很大困难 ...

特别感谢abinitio 和ChemiAndy的答疑。我用的是lammpse来做的,采用的CHO的立场,模拟的是反应历程和产物分布。
14楼2014-10-31 12:37:18
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abinitio

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
被问到这个问题是正常的,一般来说,模拟的体系是一个没有界面,没有缺陷的理想晶体,因此,会存在过热现象。另外,势函数也会影响模拟的熔点值。

可参考以下文献:

Zhang, S. L. et al. Phys. B Condens. Matter 406, 2637–2641 (2011).
L. Han, Q. An, R. Fu, L. Zheng, S. Luo.Phys. B: Condens. Matter, 405 (2010), p. 748
P. Buffat, J. Borel.Phys. Rev. A, 13 (1976), p. 2287
A. Kuksin, et al. Comput. Phys. Commun., 177 (2007), p. 34
2楼2014-10-29 08:19:55
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荷西树

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by abinitio at 2014-10-29 08:19:55
被问到这个问题是正常的,一般来说,模拟的体系是一个没有界面,没有缺陷的理想晶体,因此,会存在过热现象。另外,势函数也会影响模拟的熔点值。

可参考以下文献:

Zhang, S. L. et al. Phys. B Condens. Ma ...

谢谢您
3楼2014-10-29 12:05:22
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abinitio

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by 荷西树 at 2014-10-29 12:05:22
谢谢您...

不客气。建议你用文献中的固液平衡法获得一个接近实验熔点的结果,这样就可以解释审稿人的问题。
4楼2014-10-29 14:31:19
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