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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 综合其他 » 如何查到基因的GO ID ??
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心醉神迷

金虫 (正式写手)

[求助] 如何查到基因的GO ID ?? 已有1人参与

如何查找基因的GO ID？？？
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1楼 2014-10-23 23:12:17
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peterrjp

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
6楼: Originally posted by 心醉神迷 at 2014-10-24 10:59:08
输入基因名，点第一个绿色的小框框，出来的是这个http://amigo.geneontology.org/amigo/gene_product/UniProtKB9WFZ5怎么和你给的我最后那两个链接里的项目不一样呀？...

点击Direct annotation那列，注意跟倒数第一排的基因名对应
不是你说的绿框
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7楼2014-10-24 11:03:02
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peterrjp

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
心醉神迷: 金币+8, ★★★★★最佳答案 2014-10-24 11:00:01
在GO的官网搜基因的名字：
http://geneontology.org/
结果里再点击“Genes and gene product”，
再点击“Direct annotation”里的条目，然后就能看到GO号，找不到说明这个基因没有GO号

或者在ncbi的gene库里搜：
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene
然后点击最符合条件的结果条目
在General gene information里可能会有Gene Ontology，点击条目也能进入上一个方法的GO界面看GO号
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2楼2014-10-24 09:18:36
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心醉神迷

金虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by peterrjp at 2014-10-24 09:18:36
在GO的官网搜基因的名字：
http://geneontology.org/
结果里再点击“Genes and gene product”，
再点击“Direct annotation”里的条目，然后就能看到GO号，找不到说明这个基因没有GO号

或者在ncbi的gene库里 ...

谢谢回复。我是想找一个大肠杆菌otsB基因的基因功能。GO官网打开以后有三个能输入东西的地方，我要在哪里输入呢？左边Search GO data里输入之后有结果，但是我没有找到Genes and gene product这一项，右边有个小放大镜的那个输入框里输入我的基因名之后没有结果。蒽，怎么回事呀？蒽，NCBI上能找到Gene ID，可是我想要的是使用GO的MF子库用的GO ID额。。
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3楼2014-10-24 09:50:59
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心醉神迷

金虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by peterrjp at 2014-10-24 09:18:36
在GO的官网搜基因的名字：
http://geneontology.org/
结果里再点击“Genes and gene product”，
再点击“Direct annotation”里的条目，然后就能看到GO号，找不到说明这个基因没有GO号

或者在ncbi的gene库里 ...

GO不是有一个能够找到基因功能的子库MF么？你知道怎么用嘛？我想用他找到otsB的基因功能。。。
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4楼2014-10-24 10:00:53
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